[发明专利]一种基于SSR标记的京红3号萝卜杂交种纯度鉴定的方法有效
申请号: | 201510012424.4 | 申请日: | 2015-01-04 |
公开(公告)号: | CN104561320B | 公开(公告)日: | 2017-08-15 |
发明(设计)人: | 张丽;王庆彪 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
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地址: | 100097 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 ssr 标记 萝卜 杂交种 纯度 鉴定 方法 | ||
1.一种用于京红3号萝卜杂交种纯度鉴定的引物序列,其特征在于,所述引物核苷酸序列如序列表SEQ ID No.1~2所示。
2.利用权利要求1中所述引物检测京红3号萝卜杂交种纯度的方法,其特征在于包括以下步骤:
(1)快速提取京红3号萝卜杂交种基因组DNA:种子发芽72小时后,取下胚轴置于2.0mL离心管中;加入0.4mol·L-1NaOH溶液100μl,钢珠2个;在48孔研磨器上研磨1min;轻甩离心后,放于沸水中温浴1min;10000rmp离心1min;取上清液10μl放入96孔PCR板中,加200μl pH=8.0的Tris缓冲液,混匀备用;
(2)采用如序列表SEQ ID No.1~2所示引物进行PCR扩增:反应体系为:1μl含Mg2+的10×Buffer,0.8μl 2.5mM dNTP,1U Taq DNA聚合酶,10μM SSR上下游引物各加0.5μl,模板DNA 2μl,ddH2O补足至10μl;PCR反应程序为94℃预变性5min;35个扩增循环,94℃30sec,60℃30sec,72℃1min;72℃延伸7min,4℃保存;
(3)将步骤(2)的扩增产物经10%聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染法染色,照相并统计结果,比较京红3号杂交种及其双亲的特征谱带,表现共显性互补带型的为京红3号杂交种,只有亲本之一带型的为非杂交种,出现其他第三种带型的为外来杂种;
(4)利用步骤(3)的统计结果计算供试京红3号萝卜杂交种纯度:送检测京红3号杂交种纯度%=(总检测种子粒数-非杂交种数-外来杂种数)/总检测种子粒数×100%。
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