[发明专利]基于SSR基因型生成果树SSR分子身份证号码的方法在审
申请号: | 201510022778.7 | 申请日: | 2015-01-16 |
公开(公告)号: | CN104651495A | 公开(公告)日: | 2015-05-27 |
发明(设计)人: | 薛华柏;李秀根;张慧蓉;杨健;王龙;王苏珂 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院郑州果树研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京冠和权律师事务所 11399 | 代理人: | 朱健 |
地址: | 450009*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 ssr 基因型 生成 果树 分子 身份证号码 方法 | ||
1.一种基于SSR基因型生成果树SSR分子身份证号码的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
筛选用于果树品种扩增的SSR引物,对果树品种进行PCR扩增;
PCR扩增产物经电泳检测后,统计果树品种在各SSR位点的基因型;
将各SSR位点的基因型按升序进行排序,并为每个SSR位点的基因型设置2位字符编号,所述基因型编号依次按照升序方式进行赋值;
将果树品种对应的各SSR位点的基因型编号按照预定的SSR位点顺序串联,从而生成SSR分子身份证号码。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,统计果树品种在各SSR位点的基因型具体为:按照“第一分子量/第二分子量”的格式,统计果树品种在各SSR位点的基因型。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,为每个SSR位点的基因型设置2位字符编号,具体为:如果是没有PCR扩增产物的“零基因型”,则基因型编号赋值为“00”,其余基因型编号按照升序方式依次从01向99赋值。
4.根据权利要求1所述的方法,其中,为每个SSR位点的基因型设置2位字符编号,还包括:当00~99共100个编号用完后,还可引入字母从aa向zz增加。
5.根据权利要求2所述的方法,其中,第一分子量小于等于所述第二分子量,当基因型纯合时,第一分子量等于第二分子量,当基因型杂合时,第一分子量小于第二分子量。
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