[发明专利]用于构建基因地形图的方法、装置及系统有效
申请号: | 201510067050.6 | 申请日: | 2015-02-09 |
公开(公告)号: | CN104636463B | 公开(公告)日: | 2019-05-10 |
发明(设计)人: | 陈越;李濛 | 申请(专利权)人: | 陈越 |
主分类号: | G06F16/53 | 分类号: | G06F16/53;G06T11/00 |
代理公司: | 北京恒都律师事务所 11395 | 代理人: | 李向东 |
地址: | 100102 北京市朝*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 地形图 构建 基因 基因数据 后台服务器 装置及系统 基因作用 请求信息 属性信息 信息表达方式 基因系统 用户展示 保存 触发 预置 调用 数据库 直观 发送 指令 返回 响应 携带 分析 进程 | ||
1.一种用于构建基因地形图的方法,其特征在于,包括:
响应于触发的构建基因地形图的指令,发送第一请求信息至后台服务器,其中,所述第一请求信息中携带有用于标识所需构建地形图的基因的属性信息,所述基因的属性信息包括基因的基因名和对应的差别基因表达信息;
接收所述后台服务器返回的基因数据信息,并进行保存,其中,所述基因数据信息为所述后台服务器在数据库中获取的与所述基因的属性信息对应的基因数据信息,所述基因数据信息包括:所述基因的基因名和对应的差别基因表达信息的位置信息、影响信息以及基因组字段的数据信息;
调用预置的用于构建基因地形图的进程,对保存的所述基因数据信息进行处理,生成所需的基因的地形图,
其中,所述调用预置的用于构建基因地形图的进程,对保存的所述基因数据信息进行处理,生成所需的基因的地形图,包括:
根据所述基因数据信息中的所述位置信息,获得基因的二维坐标信息,其中,所述二维坐标信息包括横向坐标x0和纵向坐标y0;
根据所述基因数据信息中的所述影响信息,确定基因的影响值
根据如下公式,确定基因的影响总值f(x,y):
其中,A表示基因对应的差别基因表达信息值,表示基因的影响值,x和y分别表示用于基因地形图的横向坐标和纵向坐标,分别是在二维平面上横轴和纵轴的位置参数;
根据确定的所述影响总值f(x,y),按照所述基因的二维坐标信息构建包含有基因标识的图标在其二维坐标位置上,并根据所述基因的影响总值f(x,y)的大小在对应的横向坐标x和纵向坐标y位置上进行颜色渲染,以便生成所需的基因的地形图。
2.一种用于构建基因地形图的方法,其特征在于,包括权利要求1所述的方法,还包括:
接收前台终端发送的第一请求信息,其中,所述第一请求信息中携带有用于标识所需构建地形图的基因的属性信息,所述属性信息包括基因的基因名和对应的差别基因表达信息;
根据所述第一请求信息中携带的所述基因的属性信息,在数据库中获取与所述属性信息对应的基因数据信息,所述基因数据信息包括:基因的基因名和对应的差别基因表达信息的位置信息、影响信息以及基因组字段的数据信息;
将获取的所述基因数据信息输出至所述前台终端。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述根据所述第一请求信息中携带的所述基因的属性信息,在数据库中获取与所述属性信息对应的基因数据信息,包括:
解析所述第一请求信息,获得所述第一请求信息中携带的属性信息;
根据获得的所述基因的基因名和对应的差别基因表达信息,在所述数据库中获取所述基因的基因名和对应的差别基因表达信息的位置信息、影响信息以及基因组字段的数据信息,作为所述基因数据信息。
4.如权利要求2或3所述的方法,其特征在于,在所述接收前台终端发送的第一请求信息之前,还包括:
预先从基因信息系统中获取基因信息,并分类存储至所述数据库中与所述基因信息对应的位置。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述预先从基因信息系统中获取基因信息,并分类存储至所述数据库中与所述基因信息对应的位置,包括:
响应于触发的基因信息获取指令,发送第二请求信息至所述基因信息系统;
接收所述基因信息系统返回的基因信息,所述基因信息包括:差别基因表达信息、基因共表达网络信息以及基因的影响信息;
将接收的所述差别基因表达信息、所述基因共表达网络信息以及所述基因的影响信息,分别存储至所述数据库中与其对应的字段当中。
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