[发明专利]基因芯片图像的自动对比度增强方法有效
申请号: | 201510072881.2 | 申请日: | 2015-02-12 |
公开(公告)号: | CN104616264B | 公开(公告)日: | 2017-12-19 |
发明(设计)人: | 邵桂芳;李铁军;许两有;文玉华;刘暾东 | 申请(专利权)人: | 厦门大学 |
主分类号: | G06T5/00 | 分类号: | G06T5/00 |
代理公司: | 厦门市精诚新创知识产权代理有限公司35218 | 代理人: | 李伊飏 |
地址: | 361000 *** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因芯片 图像 自动 对比度 增强 方法 | ||
1.基因芯片图像的自动对比度增强方法,包括如下步骤:
步骤1:将待处理的基因芯片图像进行数字处理,用f(x,y)表示数字处理过的基因芯片图像灰度值;
步骤2:统计背景灰度值k;
步骤3:计算图像对比度C,具体包括如下过程:
步骤31:计算图像f(x,y)的水平投影信号x,即将二维信号转换为一维信号;
步骤32:计算均值标准差均方根误差四阶矩
步骤33:根据上述计算获得图像对比度C=s/[s4/(s2)2]1/4;
步骤4:对图像灰度值f(x,y)进行扫描,如果f(x,y)≤k,则判断该像素点是背景,则保留图像内容,如果f(x,y)>k,则代表该像素点为基因点则进行对比度增强;利用步骤3计算得到的图像对比度值C,获得增强倍数10000/C,具体增强过程为
2.根据权利要求1所述的基因芯片图像的自动对比度增强方法,其特征在于:为了去除增强后的噪声影响,还包括步骤5:对步骤4处理后的图像灰度值f(x,y)进行噪声滤除,其具体包括如下过程:
步骤51:采用中值滤波器对图像进行扫描,针对图像灰度值f(x,y)对应的增强图像g(x,y)中的某个像素点(x,y),取其邻域图像块g(x+k,y+l),其中l,k∈[-1,1];
步骤52:对图像块进行从小到大排序gs=sort(g(x+k,y+l));
步骤53:取中间值g′(x,y);
步骤54:重复步骤51-步骤53,最后得到滤除噪声后的图像g′(x,y)。
3.根据权利要求2所述的基因芯片图像的自动对比度增强方法,其特征在于:
步骤1中,为简化计算,将图像灰度值f(x,y)由16位转换为8位f(x,y)=f(x,y)/256,同时,步骤5还包括还原图像的步骤:
步骤55:还原图像g′(x,y)=g′(x,y)*256。
4.根据权利要求1或2或3所述的基因芯片图像的自动对比度增强方法,其特征在于:步骤2中,统计背景灰度值k包括如下过程:将图像灰度值f(x,y)切分为若干个小窗口,统计这若干个小窗口的最大灰度值,形成最大灰度值集合;取最大灰度值集合中的最小值作为背景灰度值k。
5.根据权利要求4所述的基因芯片图像的自动对比度增强方法,其特征在于:
步骤2具体包括如下过程:
步骤21:为方便统计背景灰度值,采用10×10的滑动窗口在图像灰度值f(x,y)的边缘位置扫描,取每个窗口内最大灰度值,形成最大灰度值集合;
步骤22:为消除噪声影响,针对图像灰度值f(x,y)的每个边缘位置,分别随机选择两边和中间三个位置,共计12个窗口位置,最后取最大灰度值集合中的最小值作为背景灰度值,即其中Aj表示每个窗口,m代表重复实验次数。
6.根据权利要求5所述的基因芯片图像的自动对比度增强方法,其特征在于:
所述步骤2还包括步骤23:为了避免随机性以及噪声影响,重复步骤2-步骤3多次,取其平均值作为最后的背景估计值k。
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