[发明专利]一种用于检测LEPR基因127bpdeletion可变剪接体的引物、试剂盒及检测方法有效
申请号: | 201510077400.7 | 申请日: | 2015-02-13 |
公开(公告)号: | CN104673910B | 公开(公告)日: | 2017-12-01 |
发明(设计)人: | 刘小军;王丹丹;王台安;蒋瑞瑞;徐春林;李转见;田亚东;康相涛 | 申请(专利权)人: | 河南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 郑州天阳专利事务所(普通合伙)41113 | 代理人: | 聂孟民 |
地址: | 450002*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 lepr 基因 127 bp deletion 可变 剪接 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测LEPR基因127bp deletion可变剪接体的的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)以待测cDNA为模板,以引物对ACTB为引物,实时荧光定量PCR扩增ACTB内参基因,以引物对P为引物,实时荧光定量PCR扩增LEPR基因127bp deletion可变剪接体,所述的荧光定量PCR扩增的反应体系由2×SYBR®Premix Ex TaqTMⅡ 9~11μL,去RNA酶的超纯水7~8μL,引物P-F或ACTB-F0.5~1μL,引物P-R或ACTB-R0.5~1μL和cDNA模板0.5~1.5μL构成,其反应方法是92~96℃预变性4~6min,92~96℃变性8~12s,55~65℃退火25~35 s,70~74℃延伸25~35s,35~45个循环;
所述的引物是针对LEPR基因mRNA水平127bp缺失后的部分第9外显子和第10外显子连接处的序列-CTTGTGAACGATCGCATGTG-设计识别该可变剪接体的特异性引物P-F;在第10外显子上设计该可变剪接体的引物P-R,引物对P只能扩增有127bp缺失的剪接体,从而避开其他已知或未知LEPR基因可变剪接体的干扰;
所述的引物对P为:
上游引物,P-F:5’- CTTGTGAACGATCGCATGTG -3’;
下游引物,P-R:5’- GTGGTATCTTAACTGCAAGG -3’;
所述的引物对ACTB为:
上游引物,ACTB-F:5’- GAGAGAAGATGACACAGAC -3’;
下游引物,ACTB-R:5’- GTCCATCACAATACCAGTGG -3’;
(2)对步骤(1)的荧光定量PCR实时监测结果进行扩增曲线和熔解曲线分析,采用 2-△CT相对定量的方法计算,用SPSS version 20.0进行差异显著性检验。
2.根据权利要求1所述的检测LEPR基因127bp deletion可变剪接体的方法,其特征在于,所述的反应体系由2×SYBR®Premix Ex TaqTMⅡ 10.0μL,去RNA酶的超纯水7.4μL,引物P-F或ACTB-F0.8μL,引物P-R或ACTB-R0.8μL和cDNA模板1.0μL构成,其反应方法是94℃预变性5min,94℃变性10 s,60℃退火 30 s,72℃延伸30s,40个循环。
3.根据权利要求1所述的检测LEPR基因127bp deletion可变剪接体的方法,其特征在于,所述步骤(1)中引物对ACTB的扩增产物长度为116bp,引物对P的扩增产物长度为131bp。
4.根据权利要求1所述的检测LEPR基因127bp deletion可变剪接体的方法,其特征在于,
所述步骤(2)中采用相对定量方法计算该剪接体的相对表达量=2-△CT =2-(CTLEPR-CTACTB),为方便比较结果均乘以1000;所述的SPSS version 20.0软件差异显著性检验,采用单因素方差分析,P≤0.01表示差异极显著,所有结果均以平均值和标准差来表示。
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