[发明专利]与类风湿关节炎相关的单个基因单核苷酸多态性位点及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及生物医学领域中与类风湿关节炎相关的单个基因单核苷酸多态性位点及其应用。

背景技术

类风湿关节炎是一种病因尚未确定的慢性全身性炎症性疾病，以多滑膜关节炎和关节外病变为主要临床表现，属于自身免疫炎性疾病，与环境、细胞、病毒、遗传、性激素及神经精神状态等因素密切相关，若不及时治疗易造成不可逆转的关节畸形和强直，致残率较高。类风湿关节炎已成为世界范围关注的主要健康问题之一，在世界范围内发病率约为0.5％-1％，在我国发病率约为0.4％。

类风湿关节炎的发病机制尚未明确，大量研究证实其发病与遗传因素以及环境因素存在密切关系。因此鉴定出与类风湿关节炎发病相关的易感基因或致病基因，并在人群中筛选出增加疾病风险的易感基因以确定易感个体，将有助于类风湿关节炎的发病风险预测、新药开发以及针对类风湿关节炎的诊断和个体化治疗。早期识别类风湿关节炎易感人群，采取针对性的生活方式干预，是减少类风湿关节炎发生，减缓医疗费用增长的关键，同时也可以为临床治疗提供可参考的信息。

在过去的研究中，人们已发现了多种与类风湿关节炎发病相关的易感基因，比较重要的有人类白细胞抗原(HLA)的DR区以及肿瘤坏死因子α(TNF-α)基因等，这些基因上的某些单核苷酸多态性位点显著性地增加了类风湿关节炎的发病风险。由于类风湿关节炎属于自身免疫疾病，免疫细胞中表达的基因与类风湿关节炎发病及病程的相关性一直受到人们的关注。编码B细胞、单核细胞、粒细胞等免疫细胞表面的抑制型受体分子FcγRIIB的FCGR2B基因被发现是一些自身免疫疾病的易感基因，FCGR2B基因中存在单核苷酸多态性位点rs1050501，rs1050501位点的风险等位基因为C，野生型等位基因为T。rs1050501位点被发现与系统性红斑狼疮的发病风险存在显著相关性。对于类风湿关节炎，过去的三项研究显示，在荷兰(Arthritis&Rheumatism,2004,54(12):3828-3837)、日本(Genes and immunity,2002,3(8):488-493)以及中国台湾(Genes and immunity,2008,9(8):680-688)的人群中，rs1050501与类风湿关节炎的发病并无显著相关性。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是如何在中国大陆人群中筛查类风湿关节炎患者和如何预测类风湿关节炎患者的病情严重程度。

为解决上述技术问题，本发明首先提供了下述A1)-A7)中的任一种用途：

A1)检测人基因组中rs1050501的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备筛查类风湿关节炎患者产品中的应用；

A2)检测人基因组中rs1050501的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备预测类风湿关节炎患者病情的产品中的应用；

A3)检测人基因组中rs1050501的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备检测类风湿关节炎易感性产品中的应用；

A4)检测人基因组中rs1050501的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备检测与类风湿关节炎相关的单核苷酸多态性的产品中的应用；

A5)检测人基因组中rs1050501的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定与类风湿关节炎相关的单核苷酸多态性的产品中的应用；

A6)人基因组中rs1050501的多态性(即等位基因)或基因型在制备筛查类风湿关节炎患者的产品或预测类风湿关节炎患者病情的产品中的应用；

A7)人基因组中rs1050501的多态性(即等位基因)或基因型在制备检测类风湿关节炎易感性产品中的应用。

rs1050501是人染色体1q23.3上的一个二等位多态性的SNP位点，该变异是转换(T/C，在其互补链上则为A/G)。所述rs1050501基因型是CC、TC或TT。所述CC是rs1050501位点为C的纯合型，所述TT是rs1050501位点为T的纯合型，所述TC是rs1050501位点为T和C的杂合型。所述检测人基因组中rs1050501的多态性(即等位基因)或基因型具体可为检测rs1050501的核苷酸种类。

上述用途中，所述检测人基因组中rs1050501的多态性(即等位基因)或基因型的物质可包括扩增包括rs1050501在内的基因组DNA片段的PCR引物对和成套探针。

上述用途中，所述CC和所述TC基因型的个体在类风湿关节炎患者群体中的比例分别高于对应的基因型在正常人群体中的比例。