[发明专利]一种嗜水气单胞菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法

权利要求书

1.一种嗜水气单胞菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法，其特征在于：包括如下步骤：

(1)收集嗜水气单胞菌活菌体0.5～0.7g，用5～7mL去离子水重悬，反复冻融破碎细胞，离心后收集上清液，得到模板；

(2)将该模板与氟喹诺酮类药物耐药基因检测引物GyrA-F、GyrA-R、GyrB-F、GyrB-R、ParC-F和ParC-R共同混合后，进行PCR扩增，该PCR扩增的反应体系中包括超纯水、PCR缓冲液、终浓度均为0.25～0.35mmol/L的dNTPs、终浓度为0.5～0.6mmol/L的GyrA-F、终浓度为0.5～0.6mmol/L的GyrA-R、终浓度为0.8～0.9mmol/L的GyrB-F、终浓度为0.8～0.9mmol/L的GyrB-R、终浓度为0.4～0.5mmol/L的ParC-F、终浓度为0.4～0.5mmol/L的ParC-R和终浓度为0.01～0.02U/uL的TaqDNA聚合酶，其中GyrA-F、GyrA-R、GyrB-F、GyrB-R、ParC-F和ParC-R分别如SEQ ID 1、SEQ ID 2、SEQ ID 3、SEQ ID 4、SEQ ID 5和SEQ ID 6，上述PCR缓冲液的10倍母液中包括30～35mM氯化钾、pH8.3的10mMTris-HCl和0.01～0.02％硫酸钠，25～30mM MgCl₂；

(3)步骤(2)的PCR扩增结束后，进行琼脂糖凝胶电泳并送交测序。

2.如权利要求1所述的一种嗜水气单胞菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法，其特征在于：所述步骤(1)为：收集嗜水气单胞菌活菌体0.5～0.6g，用5～6mL去离子水重悬，反复冻融破碎细胞，10000～12000rpm离心10～15min后收集上清液，得到模板。

3.如权利要求1所述的一种嗜水气单胞菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法，其特征在于：所述PCR扩增的反应体系中包括超纯水、PCR缓冲液、终浓度均为0.3mmol/L的dNTPs、终浓度为0.5mmol/L的GyrA-F、终浓度为0.5mmol/L的GyrA-R、终浓度为0.8mmol/L的GyrB-F、终浓度为0.8mmol/L的GyrB-R、终浓度为0.4mmol/L的ParC-F、终浓度为0.4mmol/L的ParC-R和终浓度为0.01U/uL的TaqDNA聚合酶。

4.如权利要求1所述的一种嗜水气单胞菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法，其特征在于：所述PCR缓冲液的10倍母液中包括30mM氯化钾、pH8.3的10mMTris-HCl和0.01％硫酸钠，25mM MgCl₂。

5.如权利要求1至4中任一权利要求所述的一种嗜水气单胞菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法，其特征在于：所述PCR扩增的反应条件如下：94～95℃预变性10～12min，然后进入如下循环：94～95℃变性50s～1min、54～55℃退火45～50s、72～74℃延伸50s～1min，共30～35个循环，循环结束后于72℃延伸7～8min，2～4℃保存。

6.如权利要求5所述的一种嗜水气单胞菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法，其特征在于：所述PCR扩增的反应条件如下：94℃预变性10min，然后进入如下循环：94℃变性1min、54℃退火50s、72℃延伸1min，共30个循环，循环结束后于72℃延伸8min，4℃保存。

7.如权利要求1所述的一种嗜水气单胞菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法，其特征在于：所述步骤(3)的电泳条件为：2％琼脂糖凝胶，80V电压，时间40min。