[发明专利]一种基于核酸外切酶和G四聚体的分子检测方法及检测试剂盒有效

专利信息
申请号: 201510102244.5 申请日: 2015-03-09
公开(公告)号: CN104726573B 公开(公告)日: 2017-03-29
发明(设计)人: 陈俊华;周顺桂;温俊林 申请(专利权)人: 广东省生态环境与土壤研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/44
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司44205 代理人: 郑莹
地址: 510650 *** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 核酸外切酶 四聚体 分子 检测 方法 试剂盒
【说明书】:

技术领域

发明涉及一种分子检测方法,特别涉及一种基于核酸外切酶和G四聚体的分子检测方法及检测试剂盒。

背景技术

环境中存在多种对人体有害的分子,快速、低成本地检测出这些有害小分子具有非常实际的意义。

17b-雌二醇被认为是作用最强烈、最具潜在影响的一类内分泌干扰物,广泛存在于河流、土壤、大气以及农产品中。它主要来源于杀虫剂、废气、食品添加剂、人畜排泄物及生活污水,即使在极低的浓度下也会对生物体产生明显的影响,其含量水平与前列腺癌、乳腺癌、卵巢癌、子宫癌以及男性生殖障碍具有显著相关性。传统的17b-雌二醇检测方法主要有高效液相色谱法、气质联用法、液质联用法等,这些方法需要繁琐的样品前处理和昂贵的仪器,检测成本高、费时耗力,需要经验丰富的操作人员,而且难以实现大批量样本的现场快速分析。另一种方法是以抗体来检测17b-雌二醇,但是抗体的制备过程繁琐,保存麻烦,而且要涉及多次洗涤与分离过程,因而限制了它们的广泛应用。

G四聚体序列是由富含G碱基的一段单链DNA组成,在缓冲体系和hemin(氯高铁血红素)存在的情况下,可折叠成G四聚体二级结构。G四聚体具有类似HRP(辣根过氧化物酶)的催化活性,可催化氧化TMB(四甲基联苯胺)产生蓝色底物,使反应溶液肉眼可见。以G四聚体来检测分子具有操作简单,方便现场快速分析等优点。但是基于G四聚体的比色法检测灵敏度低,需要进一步提高灵敏度。传统的信号放大技术主要是PCR以及一系列依赖工具酶的信号扩增技术,但是酶的使用不仅增加了成本和操作步骤,而且酶的存储也比较麻烦,因此需要研发一种无需工具酶信号扩增技术来提高检测灵敏度。

核酸适体(aptamer,源于拉丁语)指的是经体外筛选技术SELEX(指数富集配体系统进化)筛选出的能特异结合蛋白质或其他小分子物质的寡聚核苷酸片段。它是一系列单链核酸分子,与特异靶分子相结合,特异性如同抗体一样,对可结合的配体有严格的识别能力和高度的亲和力。

发明内容

本发明的目的在于提供一种基于核酸外切酶和G四聚体的分子检测方法及检测试剂盒。

本发明所采取的技术方案是:

一种基于核酸外切酶和G四聚体的分子检测试剂盒,包括TMB显色缓冲液、氯高铁血红素、DNA杂交缓冲液,还包括核酸外切酶和如下核酸序列:

DNA1:待测分子核酸适体的一端适当延伸,形成DNA1,延伸的核酸中,靠近核酸适体一端的为1*区,其余部分记为2*区;

DNA2:DNA2与DNA1的1*区和核酸适体的部分核酸连续互补配对,DNA2的另一端至少有4个碱基不与DNA1互补配对;

DNA3:具有茎环结构,其一端为1区,中间依次为2区和连接序列,另一端为G四聚体序列,G四聚体至少有6个碱基的核酸序列位于茎环结构的茎上,DNA3的1区与DNA1的1*区完全互补配对,2区与2*区靠近1*区核酸至少部分连续互补配对。

作为上述分子检测试剂盒的进一步改进,1*区至少具有6个碱基,2*区至少具有24个碱基。

作为上述分子检测试剂盒的进一步改进,DNA2中至少有6个碱基与待测分子核酸适体连续互补配对。

作为上述分子检测试剂盒的进一步改进,待测分子为17b-雌二醇,核酸序列如下:

DNA1:5'-GCTTCCAGCTTATTGAATTACACGCAGAGGGTAGCGGCTCTGCGCATTCAATTGCTGCGCGCTGAAGCGCGGAAGC-GCAGAT-GGGTTGGGATTACGATAGATAATA-3'(SEQ ID NO:1);

DNA2:5'-ATCTGCGCTTCCGCGCTTATAATA-3'(SEQ ID NO:2);

DNA3:5'-GGGTAGGGCGGGTTGGG-ATTACGATAGTCCAATCACAACCTATCGTAATCCCAACCC-ATCTGC-3'(SEQ ID NO:3);

DNA杂交缓冲液为Tris-HCl缓冲液,含有200 mM NaCl以及50 mM KCl;

TMB显色缓冲液,含有26.6 mM柠檬酸,51.4 mM磷酸氢二钠,25 mM KCl,10 μL 0.5%的TMB,20 μL 30%的H2O2,pH=5.0。

作为上述分子检测试剂盒的进一步改进,核酸外切酶为核酸外切酶Ⅲ。

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