[发明专利]H7N9型禽流感病毒的基因序列

说明书

技术领域

本发明涉及流感病毒的基因序列领域，尤其涉及H7N9型禽流感病毒的基因序列。

背景技术

H7N9是禽流感的一种型。流感病毒颗粒外膜由两型表面糖蛋白覆盖，一型为血细胞凝集素(即H)，一型为神经氨酸酶(即N)，H又分15个型，N分9个型。所有人类的流感病毒都可以引起禽类流感，但不是所有的禽流感病毒都可以引起人类流感，禽流感病毒中，H3、H5、H7、H9可以传染给人，其中H5为高致病性。H3为人犬共患，依据流感病毒特征可分为HxNx共135种型，H7N9型禽流感病毒是其中的一种，既往仅在禽间发现，这个病毒的生物学特点、致病力、传播力，还没有依据进行分析判断。PCR和基因芯片诊断是一种快速而准确的检测方法，而这一类的诊断方法依赖于获得特异的基因序列。

发明内容

本发明在于通过生物信息学和分子生物学技术，确定了H7N9型禽流感病毒基因序列及其PCR引物。

0发明的技术方案为：本发明确定了一段H7型禽流感病毒基因序列及其PCR引物，用引物进行PCR扩增，其正向引物序列如下：

5'-agaaatgaaa tggctcctgt caa-3'；

反向引物的序列：

5'-ggttttttct tgtattttta tatgacttag-3'；

探针的序列： 

5'FAM-agataatgct gcattcccgc agatg-BHQ1-3'；

H7型禽流感病毒基因序列为：

gcagaaatga aatggctcct gtcaaacaca gataatgctg cattcccgca gatgactaag        60，

tcatataaaa atacaagaaa aagcc                                              85；

还确定了一段N9型禽流感病毒基因序列及其PCR引物，用引物进行PCR扩增，其正向引物序列如下：

5’-tagcaatgca acacactagt caat-3’；

反向引物的序列：

5’-attacctgga taagggtcca ttacact-3’；

探针的序列： 

5’FAM- agacaatccc cgaccgaatg accc -BHQ1-3’；

N9型禽流感病毒基因序列为：

tagcaatgac acacactagt caatatatat gcagtcctgt tcttacagac actccccgac          60，

cgaatgaccc aaatataggt aagtgtaatg acccttatcc cggtaata                       108；

本发明的有益效果是：本序列的获得不仅为研究H7N9型禽流感病毒分子的作用机理奠定基础，且本发明建立的临床检测技术所使用的方法具有快速、准确、操作简便等优点，且成本也较低。

具体实施方式

以下将结合本发明的实施例进行详细叙述。

第一步 引物设计

A、序列查找：通过NCBI查找到相关的序列

B、引物探针设计：通过引物探针设计软件，在目的基因序列特异性较强的一段进行设计。

第二步 引物合成

引物探针均是在生工生物工程(上海)股份有限公司进行合成的；

第三步 提取

A、采用的试剂盒是Qiagen的，货号52904，取样，