[发明专利]一种与二花脸母猪产仔性状相关的SNP标记、检测方法及应用有效

专利信息
申请号: 201510113897.3 申请日: 2015-03-16
公开(公告)号: CN104694651B 公开(公告)日: 2017-11-14
发明(设计)人: 李平华;张叶秋;黄瑞华;贺丽春;牛清 申请(专利权)人: 南京农业大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 南京天华专利代理有限责任公司32218 代理人: 傅婷婷,徐冬涛
地址: 211225 江苏省南京市溧*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 二花脸 母猪 产仔 性状 相关 snp 标记 检测 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种基于与二花脸母猪产仔性状相关的SNP标记开发分子标记的方法,其特征在于以含有与二花脸母猪产仔性状相关的SNP标记的核苷酸序列为基础序列,设计引物对,以二花脸母猪基因组DNA为模板进行PCR扩增,使与二花脸母猪产仔性状相关的SNP标记转化为分子标记;其中,所述的与二花脸母猪产仔性状相关的SNP标记位于猪14号染色体上的二三磷酸核苷酸水解酶-1基因ENTPD1的核苷酸序列上,所述SNP标记的位点为国际猪基因组10.2版本参考序列14号染色体上g. 117011153核苷酸位点,且具有A/G多态性,所述SNP标记与二花脸母猪窝产总仔数极显著相关。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于所述的引物对序列为上游引物:SEQ ID NO:2,下游引物:SEQ ID NO:3;所述的分子标记序列如SEQ ID NO:1所示,所述的SNP位点位于第894位,存在A/G多态性。

3.一种用于检测权利要求1中所述的与二花脸母猪产仔性状相关的SNP标记的引物对,其特征在于上游引物为:SEQ ID NO:2,下游引物为:SEQ ID NO:3。

4.一种检测权利要求1中所述的与二花脸母猪产仔性状相关的SNP标记的方法,其特征在于包含PCR扩增二花脸母猪基因组中含有权利要求1中所述的与二花脸母猪产仔性状相关的SNP标记的一段序列,对扩增产物进行测序,判读该位点的A/G多态性。

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于包括以下步骤:

(1)取一头二花脸母猪的耳组织样品并提取总DNA;

(2)用已提取的二花脸母猪基因组DNA为模板,使用权利要求3所述的引物对进行PCR扩增;

(3)扩增产物进行测序,分析测序结果,判读在SEQ ID NO:1第894位的A/G多态性。

6.权利要求3所述的引物对在筛选高产二花脸母猪品系中的应用。

7.一种筛选高产二花脸母猪品系的方法,其特征在于包括检测二花脸母猪国际猪基因组10.2版本参考序列14号染色体上g. 117011153核苷酸位点的基因型,选育g. 117011153核苷酸位点的GG型个体作为种猪。

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