[发明专利]一种N4短尾病毒及玫瑰杆菌DFL12基因芯片在审
申请号: | 201510118924.6 | 申请日: | 2015-03-18 |
公开(公告)号: | CN104673756A | 公开(公告)日: | 2015-06-03 |
发明(设计)人: | 纪建达;张锐;焦念志 | 申请(专利权)人: | 厦门大学 |
主分类号: | C12N7/00 | 分类号: | C12N7/00;C12Q1/70;C12Q1/68;C12Q1/04;C40B40/06;C12R1/01;C12R1/92 |
代理公司: | 厦门南强之路专利事务所(普通合伙) 35200 | 代理人: | 马应森 |
地址: | 361005 *** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 n4 短尾 病毒 玫瑰 杆菌 dfl12 基因芯片 | ||
1.一种N4短尾病毒,为Dinoroseobacter shibae N4likevirus vB_DshP-R1,该病毒已于2014年12月25日保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏中心保藏编号为CCTCC NO:M2014666。
2.一种N4短尾病毒及玫瑰杆菌DFL12基因芯片,其特征在于其为可检测细菌及其裂解病毒多数编码基因的组合型探针芯片,即可特异检测Dinoroseobacter shibae DFL12及N4短尾病毒相互作用下基因响应的基因芯片,N4短尾病毒及玫瑰杆菌DFL12基因芯片以Dinoroseobacter shibae DFL12及其致病N4短尾病毒的4226个和86个编码基因作为检测位点,N4短尾病毒及玫瑰杆菌DFL12基因芯片采用15,208条长度为60个碱基的寡核苷酸作为组合检测探针完成的一种N4短尾病毒及玫瑰杆菌DFL12基因芯片。
3.如权利要求2所述一种N4短尾病毒及玫瑰杆菌DFL12基因芯片,其特征在于是按照表1所示的15252个序列点构成的矩阵单元点制到载体上。
4.如权利要求3所述一种N4短尾病毒及玫瑰杆菌DFL12基因芯片,其特征在于所述载体采用固相载体。
5.如权利要求4所述一种N4短尾病毒及玫瑰杆菌DFL12基因芯片,其特征在于所述固相载体为玻片。
6.如权利要求3所述一种N4短尾病毒及玫瑰杆菌DFL12基因芯片,其特征在于所述序列点是4207种长度为60个碱基的寡核苷酸。
7.如权利要求2所述一种N4短尾病毒及玫瑰杆菌DFL12基因芯片,其特征在于所述N4短尾病毒及玫瑰杆菌DFL12基因芯片是在载体面上点制组合形成有如表1所示的15252个序列点矩阵单元,诸序列点所对应的编码基因在国际基因序列库中的对应接收号如表2所示;诸序列点构成的矩阵在载体面上可完成多个平行设置;
每个序列点矩阵单元,其第1行1~7列和159~164列,第2行1~5列和161~164列,第3行1~3列和163~164列,第4行1列,第94行1~2列和164列,第95行1~4列和162~164列,第96行1~6列和160~164列共48个序列点为质控对照序列点,包括阳性质控对照序列点和阴性质控对照序列点。
8.如权利要求7所述一种N4短尾病毒及玫瑰杆菌DFL12基因芯片,其特征在于所述阳性质控对照序列点,共14个,行号-列号为:1-1,1-2,1-3,1-161,1-163,1-164,2-1,2-3,2-164,91-1,96-2,96-4,96-163和96-164;其他质控对照序列点为阴性质控对照序列点,共34个。
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