[发明专利]一种检测癌症相关DNA甲基化的试剂盒及应用

说明书

技术领域

本发明涉及生物技术领域中一种检测癌症相关DNA甲基化的试剂盒及应用。

背景技术

DNA甲基化是一项重要的表观遗传学机制，在人类癌症发生发展中发挥着重要的作用。特定基因的启动子区甲基化异常引起了人们的广泛关注，被认为是癌症诊断的潜在标志物。在癌症中只有极少数的单独基因被证明是甲基化比例很高的。因此，检测一组基因的甲基化状态，与检测单独基因的甲基化状态相比，诊断灵敏度更高、特异性更好。至今人们已研究了多种癌症的甲基化谱。对于一个理想的甲基化谱而言，准确的检测方法和逻辑的数据分析都是必不可少的。2012年，已经建立了一种统计多个基因的甲基化水平的方法，根据候选基因的甲基化水平进行癌症样本和正常样本的逐步累积分析。与以前的统计方法相比，这个方法充分考虑了不同基因的甲基化程度和影响，然而，这个方法需要对大量样本进行统计分析，因此很难应用于即时单个样本或少量样本的诊断。

发明内容

本发明的一个目的是提供检测待测样本基因组中RASSF1A基因、OPCML基因和HOXA9基因这三种基因的各自启动子区CCGG位点甲基化水平SUM值的物质的用途。

本发明提供了检测待测样本基因组中RASSF1A基因、OPCML基因和HOXA9基因这三种基因的各自启动子区CCGG位点甲基化水平SUM值的物质在制备鉴定或辅助鉴定待测样本是否为卵巢癌样本产品中的应用。

本发明的另一个目的是提供检测待测样本基因组中RASSF1A基因、OPCML基因和HOXA9基因这三种基因的各自启动子区CCGG位点甲基化水平SUM值的物质的用途。

本发明提供了检测待测样本基因组中RASSF1A基因、OPCML基因和HOXA9基因这三种基因的各自启动子区CCGG位点甲基化水平SUM值的物质在制备鉴定或辅助鉴定待测患者是否为卵巢癌患者产品中的应用。

上述应用中，所述待测样本基因组中RASSF1A基因、OPCML基因和HOXA9基因这三种基因的各自启动子区CCGG位点甲基化水平SUM值为所述待测样本基因组中RASSF1A基因、OPCML基因和HOXA9基因这三种基因的各自启动子区CCGG位点甲基化水平值赋值之和。

所述赋值标准如下：若RASSF1A基因、OPCML基因或HOXA9基因启动子区CCGG位点甲基化水平值小于0.3，则对应基因启动子区CCGG位点甲基化水平值赋值为1；若RASSF1A基因、OPCML基因或HOXA9基因启动子区CCGG位点甲基化水平值大于等于0.3且小于等于0.7，则对应基因启动子区CCGG位点甲基化水平值赋值为2；若RASSF1A基因、OPCML基因或HOXA9基因启动子区CCGG位点甲基化水平值大于0.7，则对应基因启动子区CCGG位点甲基化水平值赋值为3。

本发明第三个目的是提供检测待测样本基因组中RASSF1A基因启动子区CCGG位点甲基化水平、OPCML基因启动子区CCGG位点甲基化水平和HOXA9基因的启动子区CCGG位点甲基化水平的物质的用途。

本发明提供了检测待测样本基因组中RASSF1A基因启动子区CCGG位点甲基化水平、OPCML基因启动子区CCGG位点甲基化水平和HOXA9基因的启动子区CCGG位点甲基化水平的物质在制备鉴定或辅助鉴定待测样本是否为卵巢癌样本产品中的应用。

本发明第四个目的是提供检测待测患者基因组中RASSF1A基因、OPCML基因和HOXA9基因的启动子区CCGG位点甲基化水平的物质的用途。

本发明提供了检测待测患者基因组中RASSF1A基因、OPCML基因和HOXA9基因的启动子区CCGG位点甲基化水平的物质在制备鉴定或辅助鉴定待测患者是否为卵巢癌患者产品中的应用。

上述应用中，所述待测样本为单个样本。

上述应用中，所述产品为试剂盒。

本发明的第五个目的是提供上述物质。

本发明提供的上述物质，为如下1)或2)：

1)鉴定或辅助鉴定待测样本是否为卵巢癌样本的产品；

2)鉴定或辅助鉴定待测患者是否为卵巢癌患者产品。

上述物质包括扩增RASSF1A基因启动子区CCGG位点的引物对、扩增OPCML基因启动子区CCGG位点的引物对和扩增HOXA9基因启动子区CCGG位点的引物对。

上述物质中，所述扩增RASSF1A基因启动子区CCGG位点的引物对由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成；