[发明专利]一种腐败检材降解DNA的检测方法及其应用有效
申请号: | 201510162844.0 | 申请日: | 2015-04-03 |
公开(公告)号: | CN104726604B | 公开(公告)日: | 2017-05-24 |
发明(设计)人: | 丛斌;董春楠;李淑瑾;马春玲 | 申请(专利权)人: | 河北医科大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 石家庄国域专利商标事务所有限公司13112 | 代理人: | 白海静 |
地址: | 050017 河*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 腐败 降解 dna 检测 方法 及其 应用 | ||
1.一种核小体核心区域遗传标记的检测方法在腐败检材降解DNA法医检测中的应用;其特征在于,遗传标记的检测方法包括以下步骤:a)获取人体血液组织中位于核小体核心区域DNA;b)对所述核小体核心区域DNA进行测序;c)将测序得到的序列与人类基因组序列信息进行比对,筛选,获得了核小体核心区域STRs遗传标记;d)根据所述STRs遗传标记的序列设计上、下游引物;e)提取腐败检材的DNA;f)用设计的上、下游引物对所述腐败检材的DNA进行PCR扩增,得扩增产物;g)对所述扩增产物电泳,根据扩增获得的每个基因座进行分析;
所述STRs遗传标记为D10S1248、D18S51、TH01、TPOX或DYS391中的任意一个;
所述D10S1248遗传标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,扩增所述D10S1248遗传标记的上游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:11、下游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:12;
所述D18S51遗传标记的核苷酸序列为SEQ ID NO:2,扩增所述D18S51遗传标记的上游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:13、下游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:14;
所述TH01遗传标记的核苷酸序列为SEQ ID NO:3,扩增所述TH01遗传标记的上游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:15、下游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:16;
所述TPOX遗传标记的核苷酸序列为SEQ ID NO:4,扩增所述TPOX遗传标记的上游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:17、下游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:18;
所述DYS391遗传标记的核苷酸序列为SEQ ID NO:5,扩增所述DYS391遗传标记的上游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:19、下游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:20。
2.根据权利要求1所述的核小体核心区域遗传标记的检测方法在腐败检材降解DNA法医检测中的应用,其特征在于,将所述测序获得的序列与人类基因组序列信息进行比对时,每条测序获得的序列与人类基因组序列比对不多于3个碱基错配的为有效序列,可用于进一步筛选。
3.根据权利要求1所述的核小体核心区域遗传标记的检测方法在腐败检材降解DNA法医检测中的应用,其特征在于,所述STRs遗传标记通过编程筛选,其编程条件为:①允许有0个碱基错配;②STR重复单位的基序长度为3、4或者5bp;③STR重复单位的重复次数大于5;④对于重复单元相同的所有潜在STR,取出其两翼序列,两翼序列有任意一端长度小于10bp的过滤掉;⑤对两翼序列分别两两比较,潜在STR向左、右分别取10bp,完全相同的认定为同一个STR;⑥一个STR有3个及以上的序列支持,认定该STR遗传标记为真实存在;全部满足以上6个条件的序列为有效STRs遗传标记。
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