[发明专利]一种贝类总病毒核酸的制备方法在审
申请号: | 201510201269.0 | 申请日: | 2015-04-23 |
公开(公告)号: | CN104946624A | 公开(公告)日: | 2015-09-30 |
发明(设计)人: | 姜敬哲;黄晟;何健;王江勇 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院南海水产研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
代理公司: | 广州知友专利商标代理有限公司 44104 | 代理人: | 宣国华;马赟斋 |
地址: | 510300 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 贝类 病毒 核酸 制备 方法 | ||
1.一种贝类总病毒核酸的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)磨粉:在液氮环境下,将贝类组织样品磨成粉;
(2)匀浆:贝类组织样品粉末中加入PBS缓冲液,然后匀浆成浆料;
(3)获得总病毒粗提物:浆料经离心处理,所得的上清液经滤膜过滤后离心处理,弃上清液,所得的沉淀即为总病毒粗提物;
(4)提取核酸:所述总病毒粗提物加入核酸酶溶液,制成悬浮液,于37℃摇床处理25-40min,而后提取总病毒核酸;
(5)核酸扩增:对所述总病毒核酸进行扩增,以提高核酸浓度,有利于高通量测序。
2.根据权利要求1所述的贝类总病毒核酸的制备方法,其特征在于,所述步骤(2)中,PBS缓冲液与贝类组织样品之间的体积质量比为10-12﹕1。
3.根据权利要求1或2所述的贝类总病毒核酸的制备方法,其特征在于,所述步骤(2)中,PBS缓冲液含有以下组分:NaCl 135-140mmol/L,KCl2.5-3.0mmol/L,Na2HPO48-12mmol/L,KH2PO41-2.5mmol/L,pH7.5。
4.根据权利要求3所述的贝类总病毒核酸的制备方法,其特征在于,所述步骤(3)中,过滤前的离心处理至少进行两次,离心条件为:4℃,10000-12000rpm离心25-35min。
5.根据权利要求4所述的贝类总病毒核酸的制备方法,其特征在于,所述步骤(3)中,滤膜采用Millex-HV 0.45um滤膜。
6.根据权利要求5所述的贝类总病毒核酸的制备方法,其特征在于,所述过滤后的离心处理的条件为:10℃,35000-45000g离心1-1.5h。
7.根据权利要求6所述的贝类总病毒核酸的制备方法,其特征在于,所述步骤(4)中,核酸酶溶液含有以下组分:100U DNase I,100ug RNase A,10-12mM Tris-HCl,2.0-3.0mM MgCl2,0.5-1mM CaCl2,pH7.5。
8.根据权利要求7所述的贝类总病毒核酸的制备方法,其特征在于,所述步骤(4)中,采用HP Viral DNA/RNA Kit进行核酸提取。
9.根据权利要求8所述的贝类总病毒核酸的制备方法,其特征在于,所述步骤(5)中,采用illustra GenomiPhi HY DNA Amplification Kit进行核酸扩增。
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