[发明专利]诊断人SHOX2基因和人RASSF1A基因甲基化的方法和试剂盒有效
申请号: | 201510203539.1 | 申请日: | 2015-04-24 |
公开(公告)号: | CN104774957B | 公开(公告)日: | 2017-07-21 |
发明(设计)人: | 王方金;陈静文;姚见儿 | 申请(专利权)人: | 上海透景生命科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司31100 | 代理人: | 陈静 |
地址: | 201203 上海浦*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 诊断 shox2 基因 rassf1a 甲基化 方法 试剂盒 | ||
1.一种用于检测肺癌的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒中包括:
特异性检测人SHOX2基因的DNA甲基化的检测试剂,其是:SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:18所示的引物以及SEQ ID NO:25所示的探针;和
特异性检测人RASSF1A基因的DNA甲基化的检测试剂,其是:SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:10所示的引物以及SEQ ID NO:22所示的探针。
2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒中还包括:特异性检测内参基因的检测试剂,其是针对人β-actin基因的引物和探针。
3.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述的引物和探针针对人β-actin基因中SEQ ID NO:5经亚硫酸氢盐或重亚硫酸氢盐或肼盐修饰后的序列。
4.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述的特异性检测内参基因的DNA甲基化的检测试剂是:SEQ ID NO:19和SEQ ID NO:21所示的引物以及SEQ ID NO:26所示的探针。
5.如权利要求1-4任一所述的试剂盒,其特征在于,针对每一基因的探针连接有特定的荧光基团。
6.如权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,针对人SHOX2基因的探针标记VIC荧光素,针对人RASSF1A基因的探针标记FAM荧光素,针对人β-actin基因的探针标记CY5荧光素。
7.如权利要求1-4任一所述的试剂盒,其特征在于,该试剂盒中,针对人SHOX2基因的引物和探针的比例为:0.2:0.06;或
该试剂盒中,针对人RASSF1A基因的引物和探针的比例为:0.2:0.06;或
该试剂盒中,针对人β-actin基因的引物和探针的比例为:0.67:0.02。
8.权利要求1-4任一所述的试剂盒,其特征在于,该试剂盒中,还包括:DNA聚合酶、dNTPs、Mg2+离子或包含DNA聚合酶、dNTPs、Mg2+离子的PCR体系。
9.权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述的包含DNA聚合酶、dNTPs、Mg2+离子的PCR体系中,所述的Mg2+离子浓度为3.5±0.5mM;或所述的dNTPs浓度为0.25±0.3mM;或所述的DNA聚合酶为1.5±0.2U。
10.权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒中还包括:亚硫酸氢盐或重亚硫酸氢盐或肼盐。
11.特异性检测人SHOX2基因和人RASSF1A基因的DNA甲基化的试剂的用途,用于制备检测肺癌的试剂盒;所述的特异性检测人SHOX2基因的DNA甲基化的检测试剂是:SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:18所示的引物以及SEQ ID NO:25所示的探针;
所述的特异性检测人RASSF1A基因的DNA甲基化的检测试剂是:SEQ IDNO:7和SEQ ID NO:10所示的引物以及SEQ ID NO:22所示的探针。
12.一种体外非诊断性地检测人SHOX2基因和人RASSF1A基因的DNA甲基化的方法,其特征在于,所述方法包括:
(1)将待测样品进行亚硫酸氢盐或重亚硫酸氢盐或肼盐处理,获得经修饰的待测样品;
(2)利用权利要求1-10任一所述的用于检测肺癌的试剂盒对步骤(1)的经修饰的待测样品进行检测,获得人SHOX2基因的DNA甲基化情况和人RASSF1A基因的DNA甲基化情况。
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