[发明专利]强冬性白菜型冬油菜CAT酶分子标记及QTL定位有效
申请号: | 201510211104.1 | 申请日: | 2015-04-29 |
公开(公告)号: | CN104988212B | 公开(公告)日: | 2018-12-18 |
发明(设计)人: | 孙万仓;杨刚;刘自刚;曾秀存;武军艳;方彦;李学才;孔德晶;刘海卿;钱武 | 申请(专利权)人: | 甘肃农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 甘肃省知识产权事务中心 62100 | 代理人: | 孙惠娜 |
地址: | 730070 *** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 强冬性 白菜 油菜 cat 分子 标记 qtl 定位 | ||
本发明公开了强冬性白菜型冬油菜CAT酶分子标记及QTL位点,其筛选步骤包括:(1)利用多代套袋自交的亲本强冬性超强抗寒冬油菜‘陇油7号’和强抗寒冬油菜‘陇油9号’杂交构建F2代分离群体;(2)采用CTAB法提取两亲本及F2代分离群体的叶片DNA;(3)利用SSR和InDel引物对两亲本DNA进行多态性引物筛选;(4)通过F2分离群体获得基因型数据构建遗传连锁图和QTL分析;(5)获得了3个强冬性白菜型冬油菜CAT酶的QTL位点,分别命名为Qcat.gsau‑2A‑1、Qcat.gsau‑2A‑2和Qcat.gsau‑2A‑3;3个与强冬性白菜型冬油菜CAT酶QTL位点连锁的分子标记BrID90127、BrID10421和BrID10709。
技术领域
本发明属于分子生物学及遗传育种技术领域,具体涉及一种强冬性白菜型冬油菜CAT酶活性基因QTL位点,同时还涉及与强冬性白菜型冬油菜CAT酶活性基因QTL位点连锁的分子标记。
背景技术
白菜型油菜在我国栽培历史悠久,种质资源丰富,是我国重要的油料作物之一。但白菜型油菜以春性为主,冬性白菜型冬油菜种质缺乏,适宜北方旱寒区种植的强冬性冬油菜品种尤其缺乏。我国北方气候严寒,冬油菜具备优异的抗寒性才能安全越冬,因此抗寒品种改良是北方冬油菜发展的关键。采用常规育种方法选育抗寒材料费时费力,且选择效率较低,如果借助分子标记辅助育种,可以在苗期进行淘汰,不仅节约生产成本而且大大提高选择效率。
CAT是植物重要的保护性酶之一,在抵御外界低温环境中起着积极作用。因此CAT酶活性的高低是衡量植物抗寒性强弱的指标之一。关于CAT酶活性及其基因的研究很多,研究认为其符合数量性状的遗传特点。但不同作物中,其基因序列,表达模式、遗传效益有所不同。近年强冬性白菜型冬油菜中CAT酶活性的研究甚多,但对其分子标记及QTL定位的研究尚未见报道。本研究通过QTL定位,旨在筛选出CAT的QTL位点和分子标记,用于CAT基因的克隆和强冬性白菜型冬油菜抗寒育种的分子标记辅助选择。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是针对现有技术中的缺点而提供3个强冬性白菜型冬油菜CAT酶活性QTL位点,该3个位点的效应值都比较高,对强冬性白菜型冬油菜CAT酶活性调控起着重要作用,可用作定位克隆和分子标记辅助选择。
本发明还提供多个强冬性白菜型冬油菜油CAT酶活性的QTL位点连锁的分子标记,这些分子标记与QTL位点的遗传距离较近且是基于 PCR 技术的SSR和InDel标记,因而可靠且使用方便,将对强冬性白菜型冬油菜抗寒育种提供便利。
为解决本发明的技术问题采用如下技术方案:
强冬性白菜型冬油菜CAT酶分子标记及QTL定位,其筛选包括有以下步骤:
(1)构建分离群体:利用多代套袋自交的亲本强冬性超强抗寒冬油菜‘陇油7号’和强抗寒冬油菜‘陇油9号’配置杂交组合,杂交F1代自交产生F2代分离群体。本发明用到的实验材料由甘肃农业大学油菜遗传育种课题组提供。
(2)油菜叶片DNA提取:采用CTAB法提取亲本‘陇油7号’和 ‘陇油9号’及F2代分离群体的叶片DNA。
(3)引物来源及合成:由上海生物工程技术有限公司合成315对引物,引物来源于www.UK crop.net发表的油菜微卫星引物序列以及Brassica Database网站http://brassicadb.org/上公布的10个染色体上的所有引物,其中SSR引物51对,InDel 引物264对。
(4)多态性引物筛选:利用合成的引物对两亲本DNA进行PCR扩增,筛选出具有多态性的引物,该过程涉及PCR扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染、照相等步骤。
(5)多态性引物在F2代检测:将筛选出的多态性引物在F2代中进行检测,获得基因型数据,该过程与(4)步骤基本相同。
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