[发明专利]一种小麦寡分蘖基因Ltn3的分子标记HRM5及其应用

权利要求书

1.一种小麦寡分蘖基因Ltn3的分子标记HRM5，其特征在于，所述分子标记HRM5的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；

所述分子标记与小麦寡分蘖基因Ltn3共定位于小麦2D染色体，且与Ltn3之间的遗传距离为0.35cM；

小麦寡分蘖基因Ltn3显著降低小麦分蘖，LOD值大于5.31。

2.权利要求1所述小麦寡分蘖基因Ltn3的分子标记HRM5的鉴定方法，其特征在于，以待测植株样品的基因组DNA作为模板，用荧光定量PCR引物进行荧光定量PCR扩增，利用扩增结果进行基因型分型，将与小麦H461分为同一类型的植株鉴定为含有小麦寡分蘖基因Ltn3的分子标记HRM5的植株；

所述荧光定量PCR引物的上游引物序列如SEQ ID No.2所示，下游引物序列如SEQ ID No.3所示。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，包括以下步骤：

（1）以待测植株样品的基因组DNA作为模板，用荧光定量PCR引物进行荧光定量PCR扩增；

（2）荧光定量PCR扩增反应体系：SsoFast EvaGreen超混合液5μL、上游引物和下游引物各300ng、模板DNA 100ng、去离子水加至总量为10μL；其中，所述上游引物序列如SEQ ID No.2所示，所述下游引物序列如SEQ ID No.3所示；

（3）荧光定量PCR程序：95℃预变性5分钟；94℃变性15秒、53℃退火30秒，共50个循环；熔解曲线范围为65~95℃，每0.2℃读一次数，时间为10秒；

（4）利用步骤（3）获得的结果进行基因分型。

4.权利要求1所述分子标记HRM5的荧光定量PCR引物，其特征在于，上游引物序列如SEQ ID No.2所示，下游引物序列如SEQ ID No.3所示。

5.权利要求1所述分子标记HRM5在小麦育种中的应用。

6.权利要求4所述的荧光定量PCR引物在分子标记辅助小麦株型育种中的应用。