[发明专利]构建芥菜SSR遗传图谱的引物组及遗传图谱的构建方法

说明书

技术领域

本发明涉及植物分子标记技术，具体涉及构建芥菜SSR遗传图谱的引物组及遗传图谱的构建方法。

背景技术

芥菜(B.juncea)是十字花科芸薹属的一种重要栽培作物，作为蔬菜、油料和调味品，该物种在世界范围内广泛栽培。目前常见的芥菜类作物包括芥菜型油菜、调味品籽芥菜、菜用芥菜及其变种等，并且不同芥菜类作物之间的生物学差异很大。农艺性状都受多基因控制，其遗传改良较为复杂。通过分子标记对芥菜进行早期选择、预测，利用遗传图谱，把优良的基因分离出来，对多基因控制的复杂的性状进行遗传改良，可以提高目标基因的选择效率，加速育种进程。

目前，随着分子标记的发展与应用，越来越多的芥菜遗传图谱完成构建，其中应用较多的分子标记有RFLP、RAPD、AFLP等，但这些标记大多是采用无全基因组序列信息的技术开发得到，表现出随机性强、稳定性差等缺点。而简单重复序列(simple sequence repeat，SSR)标记具有重复性好、稳定性强、多态性高、共显性遗传和基因组中普遍存在等优点，广泛应用于遗传图谱构建、遗传多样性分析及分子标记辅助育种等研究。而目前SSR分子标记在芥菜中的应用报道很少，并且其中大多以籽用芥菜即芥菜型油菜为材料，少数以调味用芥菜为材料。还未见以我国特有蔬菜类芥菜为材料的SSR遗传图谱构建的报道。

发明内容

本发明的目的是针对现有技术的不足，提供构建芥菜SSR遗传图谱的引物组及遗传图谱的构建方法，所述引物组能特异地扩增出芥菜中含有的SSR分子标记，利用这些SSR分子标记能构建芥菜的SSR遗传图谱。

本发明的目的是通过以下技术方案实现的：构建芥菜SSR遗传图谱的引物组，包括以下112对引物：

BjSSR0001正向引物SEQ ID NO.1：AAATCCCCAAAAACCTAGAG

         反向引物SEQ ID NO.113：CTCATCCATCTCCTCGTCT

BjSSR0002正向引物SEQ ID NO.2：CTTCGTTTGCGCGTTTT

         反向引物SEQ ID NO.114：ATGATGGTCTCCTTTTGTTG

BjSSR0004正向引物SEQ ID NO.3：AAGAAGTCGAGTAGTCGCAG

         反向引物SEQ ID NO.115：AAACGAACAATACTTCCCG

BjSSR0008正向引物SEQ ID NO.4：ATGGAGCACATCTCAAAGAC

         反向引物SEQ ID NO.116：CTTTTGTTGTGATGACCCTT

BjSSR0019正向引物SEQ ID NO.5：GAAACACAAACGCAGCA

         反向引物SEQ ID NO.117：ACAGGCATTGTAGGAGACAC

BjSSR0023正向引物SEQ ID NO.6：TAAGCAGAGAAAGAAATGGG

         反向引物SEQ ID NO.118：AGATCTCTGGAGTTGGGAGT

BjSSR0166正向引物SEQ ID NO.7：GAACAACAACTCATCCACCT

         反向引物SEQ ID NO.119：AGACTCGTTATTGATGCTGG

BjSSR0234正向引物SEQ ID NO.8：ATTCTAATCACAACAACCGC

         反向引物SEQ ID NO.120：ATGTAGTAGCCAAGGTGGTG

BjSSR0312正向引物SEQ ID NO.9：AGAAGCTTGGTAAGACGACA

         反向引物SEQ ID NO.121：ATGCTCGAAGCTTTCTTATG

BjSSR0364正向引物SEQ ID NO.10：ATCCCCTCGTTAAAACTCTC

         反向引物SEQ ID NO.122：GATGTTGAGGAGGTACTGGA

BjSSR0486正向引物SEQ ID NO.11：TTCCAAATCATCTTCTCACC

         反向引物SEQ ID NO.123：CGTCCAACACAACAAACATA

BjSSR0513正向引物SEQ ID NO.12：ATCAAGAAAATGGAGCAAGA