[发明专利]一种检测穆汀斯克罗诺杆菌的方法及引物、探针和试剂盒在审
申请号: | 201510259810.3 | 申请日: | 2015-05-19 |
公开(公告)号: | CN104928366A | 公开(公告)日: | 2015-09-23 |
发明(设计)人: | 肖性龙;庄平;胡双芳;李蓉;余以刚 | 申请(专利权)人: | 华南理工大学;中山出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 宫爱鹏 |
地址: | 510640 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 穆汀斯克罗诺 杆菌 方法 引物 探针 试剂盒 | ||
1.一种用于检测穆汀斯克罗诺杆菌核苷酸片段的引物,其特征在于,所述的引物序列为:由上游引物序列5‘GGGATACGCAGGAGGTGGCA’和下游引物序列5’GATGCTGCCTGCCAGCAGG’组成的引物对;或者上述引物对的上游引物向5’端方向延伸10个碱基,向3’端方向延伸10个碱基,下游引物向3’端方向延伸10个碱基,向5’端方向延伸10个碱基区域范围内得到的引物序列。
2.一种用于检测穆汀斯克罗诺杆菌核苷酸的探针,其特征在于,所述的探针序列为:5‘CATTTTAGCGCTTGATACTCCCCTGGGC’或者为上述探针序列向3’端方向延伸10个碱基和向5’端方向延伸10个碱基区域范围内得到的探针序列。
3.一种检测穆汀斯克罗诺杆菌的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)将权利要求2所述探针一端标记有报告荧光染料,另一端标记有猝灭荧光染料;
(2)以待测样品的DNA为模板,利用权利要求1所述的上、下游引物以及上述标记有荧光素的探针进行实时荧光定量PCR反应,每个循环结束后采集数据;
(3)反应结束后根据扩增曲线判断是否有穆汀斯克罗诺杆菌。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述报告荧光染料采用下列荧光基团中的任意一种:Fam、Hex、Tet、Joe、Vic、FITC、Cy3和Cy5;所述淬灭荧光染料采用下列荧光基团中的任意一种:Tamra、Rox、Dabcy1、BHQ1和BHQ2。
5.根据权利要求3或4所述的方法,其特征在于,以25μl的反应体系计,所述实时荧光定量PCR反应的条件为:在反应体系加入10×PCR Buffer,dNTPs,上、下游引物,标记有荧光素的探针,Taq酶和3~5μl的待测样品的DNA,并用RNase Free dH2O补至总体积25μl,上述组分的终浓度如下:
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,以25μl的反应体系计,所述实时荧光定量PCR反应的条件为:
7.根据权利要求3或4所述的方法,其特征在于,所述实时荧光定量PCR反应条件是:95℃变性1min;以95℃5s,60℃40s扩增40个循环。
8.一种检测穆汀斯克罗诺杆菌的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1的上、下游引物、权利要求2中的探针、10×PCR Buffer、dNTPs和Taq酶。
9.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,以25μl的反应体系计,各组分如下:
10.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,以25μl的反应体系计,各组分如下:
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