[发明专利]鼻咽癌诊治标志物及其应用有效
申请号: | 201510290983.1 | 申请日: | 2015-06-01 |
公开(公告)号: | CN104857513B | 公开(公告)日: | 2018-07-17 |
发明(设计)人: | 杨承刚;宋宏涛 | 申请(专利权)人: | 北京泱深生物信息技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574;A61K45/06;A61K48/00;A61P35/00 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鼻咽癌 鼻咽癌组织 标志物 应用 生物信息学分析 分子生物学 高通量测序 临床诊断 预防检测 高表达 新用途 可用 验证 分析 | ||
本发明涉及鼻咽癌诊治标志物及其应用,更具体的涉及mir‑326和/或miR‑326在诊治鼻咽癌中的新用途。发明通过高通量测序分析鼻咽癌组织,获得其miRNA表达数据,进而进行生物信息学分析,选取miR‑326进行分子生物学验证,结果显示,miR‑326在鼻咽癌组织中特异性高表达,可用于临床诊断及预防检测,具有很好的实际应用价值。
技术领域
本发明涉及分子生物学领域,具体的涉及鼻咽癌诊治标志物及其应用,更具体的涉及mir-326和/或miR-326在诊治鼻咽癌中的新用途。
背景技术
miRNA通常由RNA聚合酶II(Pol II)转录生成。Pol II结合在以后形成发夹结构的颈环DNA序列附近。生成的转录本经修饰添加5’帽子结构和3’末端多腺苷酸尾巴结构,并剪切,生成的产物称为初级miRNA(pri-miRNA),该产物可能长达数千或数百核苷酸,可能包含多个miRNA环结构。
单个pri-miRNA可能含一到六个miRNA前体。这些发夹结构每个由约70nt左右的核苷酸组成。每个发卡结构附以部分序列以利于有效剪切处理。pri-miRNA中的双链发夹RNA结构被叫做DGCR8的核蛋白(DiGeorge Syndrome Critical Region 8)辨认,DGCR8同Drosha酶一起形成微处理(microprocessor)复合体。在该复合体中,DGCR8组织Drosha蛋白的RNase III结构域使其在距离发卡结构约11个核苷酸处切割pri-miRNA,使其释放发卡结构。释放的发卡结构即为前miRNA(pre-miRNA),pre-miRNA在3’存在两个悬空的核苷酸,pre-miRNA 5’为磷酸集团,3’为羟基集团。
在胞浆中,pre-miRNA发夹结构经RNase III Dicer切割处理。这种内源性核糖核酸酶(endoribonuclease)与发夹结构的3’相互作用并在环的3’和5’臂上完成切割,产生长约22nt并不完美匹配的miRNA:miRNA*双链结构。
miRNA与靶mRNA的典型作用方式主要有两种。在大多数情况下,复合物中的单链miRNA与靶mRNA的3’UTR不完全互补配对,阻断靶基因的翻译,从而调节基因表达。这种方式主要影响蛋白表达水平,并不影响mRNA的稳定性。近来,有研究对翻译抑制理论提出质疑,发现被抑制的靶mRNAs和miRNAs共同聚集于胞浆中被称为P小体(processing bodies,P-bodies)的区域,这个区域还浓缩了许多参与mRNA降解的酶类。P小体可能是作为未翻译mRNA进行暂时的可逆储存的容器,减少一些特定P小体组成蛋白的表达能够缓和miRNA介导的基因表达抑制作用。P小体是胞浆中的一定区域,它包含参与多种转录后过程的蛋白质,例如:mRNA降解(mRNA degradation)、无义介导mRNA衰退(nonsense-mediated mRNAdecay,NMD),转录抑制及RNA介导的基因沉默(RNA-mediated gene silencing)。
另一种作用方式与siRNA类似,当miRNA与mRNA完全互补配对时,Ago2蛋白通过切割mRNA直接导致其降解,实现基因沉默。以siRNA参与的RNAi为例:siRNA可与RISC结合,作为模板识别mRNA靶子,通过碱基互补配对原则,mRNA与siRNA中的反义链结合,置换出正义链。双链mRNA在Dicer酶、ATP和解旋酶共同作用下产生22nt左右的siRNA,siRNA继续同RISC形成复合体,与siRNA互补的mRNA结合,使mRNA被RNA酶裂解。这个过程也称为转录后基因沉默(PTGS)。
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