[发明专利]用于筛选枯草芽孢杆菌荧光定量PCR内参基因引物有效

专利信息
申请号: 201510298348.8 申请日: 2015-06-03
公开(公告)号: CN104846111B 公开(公告)日: 2017-09-15
发明(设计)人: 吕暾;乔春晓;王立波;谢思卿 申请(专利权)人: 福州大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 福州元创专利商标代理有限公司35100 代理人: 蔡学俊
地址: 350108 福建省福州市*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 用于 筛选 枯草 芽孢 杆菌 荧光 定量 pcr 内参 基因 引物
【权利要求书】:

1.内参基因引物在制备枯草芽胞杆菌168菌株IPTG诱导表达猪圆环病毒衣壳蛋白过程荧光定量PCR检测试剂中的应用,所述的内参基因引物序列为clsA F: GGGTCCAGAACGCTGAGAA,clsA R: AAAGCCTCCGACATAACCG;和dnaN F: GCACTTGCCGCAGATTGA,dnaN R: AATGCAAGACGGTGGCTATC; 和rpoB F: TGTCCGCATTGATCGCAC,rpoB R: TCAAGCGTATTTCGCAGGTA;

所述的内参基因为clsA、dnaN和rpoB。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:枯草芽孢杆菌荧光定量PCR内参基因筛选方法,步骤包括如下:

1)菌体总RNA的抽提、质量检测及cDNA合成;

2)SYBR Green 实时定量PCR扩增;

3)内参基因的筛选。

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:所述步骤1)中的具体步骤为:

(1)挑取枯草芽孢杆菌单菌落转接瓶中,加氯霉素至终浓度为5μg/mL,培养至对数期,OD600为0.6时,加1mM IPTG诱导, 6小时后进行RNA的提取;

(2) 取2mL菌液,12,000rpm离心收集细胞,加入液氮研磨三次,研磨充分呈白色粉末状;

(3) 加入2mL Trizol至研钵中,并将研钵中的液体全部转移至离心管中;

(4) 将裂解后样品或匀浆液室温放置 5-10 min,使得核蛋白与核酸完全分离;

(5) 加入0.4 mL 氯仿,剧烈振荡15 sec,室温放置3 min;

12,000 rpm 4℃离心10 min;

(6) 吸取上层水相转移至干净的离心管中,加入等体积异丙醇,混匀,室温放置20 min;

(7) 12,000 rpm 4°C 离心10 min,弃上清;

(8) 加入1 mL 75%乙醇洗涤沉淀,12,000 rpm 4°C 离心3 min,弃上清,室温干燥5-10 min;

(9) 加入30-50 µL RNase-free ddH2O,充分溶解RNA;

(10)取适量RNA样品,加入10×Loading Buffer,100V电压下,进行1%的琼脂糖凝胶电泳,检测RNA的完整性;

(11)将RNA进行合理倍数的稀释,测其A260及A280数值,检测RNA的纯度;

(12) 利用全式金公司的逆转录试剂盒,将RNA分别逆转录为cDNA,每一个逆转录体系中加1μg RNA,42℃逆转录15min,85℃ 5s,去除逆转录酶活性。

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