[发明专利]用于筛选枯草芽孢杆菌荧光定量PCR内参基因引物有效
申请号: | 201510298348.8 | 申请日: | 2015-06-03 |
公开(公告)号: | CN104846111B | 公开(公告)日: | 2017-09-15 |
发明(设计)人: | 吕暾;乔春晓;王立波;谢思卿 | 申请(专利权)人: | 福州大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350108 福建省福州市*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 筛选 枯草 芽孢 杆菌 荧光 定量 pcr 内参 基因 引物 | ||
1.内参基因引物在制备枯草芽胞杆菌168菌株IPTG诱导表达猪圆环病毒衣壳蛋白过程荧光定量PCR检测试剂中的应用,所述的内参基因引物序列为clsA F: GGGTCCAGAACGCTGAGAA,clsA R: AAAGCCTCCGACATAACCG;和dnaN F: GCACTTGCCGCAGATTGA,dnaN R: AATGCAAGACGGTGGCTATC; 和rpoB F: TGTCCGCATTGATCGCAC,rpoB R: TCAAGCGTATTTCGCAGGTA;
所述的内参基因为clsA、dnaN和rpoB。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:枯草芽孢杆菌荧光定量PCR内参基因筛选方法,步骤包括如下:
1)菌体总RNA的抽提、质量检测及cDNA合成;
2)SYBR Green 实时定量PCR扩增;
3)内参基因的筛选。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:所述步骤1)中的具体步骤为:
(1)挑取枯草芽孢杆菌单菌落转接瓶中,加氯霉素至终浓度为5μg/mL,培养至对数期,OD600为0.6时,加1mM IPTG诱导, 6小时后进行RNA的提取;
(2) 取2mL菌液,12,000rpm离心收集细胞,加入液氮研磨三次,研磨充分呈白色粉末状;
(3) 加入2mL Trizol至研钵中,并将研钵中的液体全部转移至离心管中;
(4) 将裂解后样品或匀浆液室温放置 5-10 min,使得核蛋白与核酸完全分离;
(5) 加入0.4 mL 氯仿,剧烈振荡15 sec,室温放置3 min;
12,000 rpm 4℃离心10 min;
(6) 吸取上层水相转移至干净的离心管中,加入等体积异丙醇,混匀,室温放置20 min;
(7) 12,000 rpm 4°C 离心10 min,弃上清;
(8) 加入1 mL 75%乙醇洗涤沉淀,12,000 rpm 4°C 离心3 min,弃上清,室温干燥5-10 min;
(9) 加入30-50 µL RNase-free ddH2O,充分溶解RNA;
(10)取适量RNA样品,加入10×Loading Buffer,100V电压下,进行1%的琼脂糖凝胶电泳,检测RNA的完整性;
(11)将RNA进行合理倍数的稀释,测其A260及A280数值,检测RNA的纯度;
(12) 利用全式金公司的逆转录试剂盒,将RNA分别逆转录为cDNA,每一个逆转录体系中加1μg RNA,42℃逆转录15min,85℃ 5s,去除逆转录酶活性。
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