[发明专利]一种检测水体鸭粪污染的巢式PCR试剂盒及其检测方法有效
申请号: | 201510300317.1 | 申请日: | 2015-06-05 |
公开(公告)号: | CN104878002B | 公开(公告)日: | 2018-09-11 |
发明(设计)人: | 张徐祥;何席伟;陈慧梅;于红霞;史薇 | 申请(专利权)人: | 南京大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/686;C12Q1/6888 |
代理公司: | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人: | 蒋海军 |
地址: | 210046 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 水体 污染 pcr 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种检测水体鸭粪污染的巢式PCR试剂盒,包括两对巢式PCR引物、dNTP、PCRbuffer、Taq酶、Mg2+溶液和ddH2O,其特征在于:所述的两对巢式PCR引物为:
SDF:5’‐GCATAGGGCAACACGGAAAG‐3’;
SDR:5’‐GTTCTGGGTGTTGTCCGGTA‐3’;
NDF:5’‐CCACGTAAATGCCAAAGATG‐3’;
NDR:5’‐CTGAGCTAGAGGAAGGCT‐3’。
2.根据权利要求1所述的检测水体鸭粪污染的巢式PCR试剂盒,其特征在于,所述PCRbuffer为10×PCR buffer,所述dNTP浓度为2.5mmol/L,所述Taq酶浓度为5U/ul,所述Mg2+溶液浓度为25mmol/L。
3.采用权利要求1或2中所述的巢式PCR试剂盒检测水体鸭粪污染的方法,其步骤为:
(1)提取待测水样DNA;
(2)以水样DNA为模板,进行第一轮PCR扩增,PCR引物为SDF和SDR;
(3)第一轮PCR扩增结束后,取PCR产物为模板,进行第二轮PCR扩增,PCR引物为NDF和NDR;
(4)凝胶电泳,观察第二轮PCR产物中是否存在长度为158bp的条带,若存在,则表明水体受到了鸭粪污染。
4.根据权利要求3所述的巢式PCR试剂盒检测水体鸭粪污染的方法,其特征在于,步骤(2)中第一轮PCR引物为SDF和SDR,反应体系为2.5ul的10×PCR buffer;2.5ul dNTP;0.1ulTaq酶;2ul Mg2+;0.5ul浓度为10umol/L上、下游引物SDF 、SDR ;2ul模板DNA;灭菌ddH2O补足至25ul;反应条件为95℃,预变性5min;95℃30s,57℃30s,72℃45s,40个循环;72℃7min,4℃保存。
5.根据权利要求3所述的巢式PCR试剂盒检测水体鸭粪污染的方法,其特征在于,步骤(3)中第二轮PCR引物为NDF和NDR,反应体系为2.5ul的10×PCR buffer;2.5ul dNTP;0.1ulTaq酶;2ul Mg2+;0.5ul浓度为10umol/L上、下游引物NDF 、NDR ;0.5ul模板DNA;灭菌ddH2O补足至25ul;反应条件为95℃,预变性3min;95℃15s,60℃15s,72℃30s,40个循环;72℃7min,4℃保存。
6.根据权利要求3所述的巢式PCR试剂盒检测水体鸭粪污染的方法,其特征在于,步骤(4)中凝胶电泳为1%琼脂糖凝胶电泳,电泳条件为:电压120V,电流440mA,时间25min。
7.根据权利要求3所述的巢式PCR试剂盒检测水体鸭粪污染的方法,其特征在于:步骤(4)中检测阈值为0.0012ng/ul鸭粪DNA。
8.根据权利要求3所述的巢式PCR试剂盒检测水体鸭粪污染的方法,其特征在于:步骤(2)后对第一轮PCR产物进行凝胶电泳,若存在长度为722bp的条带,则表明水体受到了较严重的鸭粪污染,检测阈值为0.019ng/ul鸭粪DNA,无需进行步骤(3)和步骤(4)。
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