[发明专利]茄子甘露糖焦磷酸化酶SmGMP蛋白及其编码基因在审

专利信息
申请号: 201510333419.3 申请日: 2015-06-16
公开(公告)号: CN104928268A 公开(公告)日: 2015-09-23
发明(设计)人: 陈火英;蒋明敏;刘杨;任丽;葛海燕 申请(专利权)人: 上海交通大学
主分类号: C12N9/12 分类号: C12N9/12;C12N15/54;C12N15/11;C12N15/113
代理公司: 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 代理人: 郭国中;陈少凌
地址: 200240 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 茄子 甘露 磷酸化酶 smgmp 蛋白 及其 编码 基因
【说明书】:

技术领域

发明涉及茄子抗坏血酸合成途径中的关键酶及其编码基因,具体涉及一种茄子甘露糖焦磷酸化酶SmGMP蛋白及其编码基因,属于生物技术领域。

背景技术

抗坏血酸是植物体内最重要的抗氧化物质之一,它可以直接清除植物在逆境或正常代谢中产生的活性氧。其次,抗坏血酸能够维持另一种重要的抗氧化剂维生素E处于还原状态,并通过抗坏血酸-谷胱甘肽循环间接清除H2O2,从而保护植物免于氧化胁迫的伤害。

目前为止,植物中抗坏血酸的生物合成被认为有4种途径,其中受公众认可的是L-半乳糖途径。GMP(GDP-D-mannose pyrophosphorylase),又称为VTC1,是L-半乳糖途径的第一个酶,它催化甘露糖-1-磷酸转化为GDP-D-甘露糖。对拟南芥抗坏血酸缺失突变体vtc1的研究表明,该突变体与野生型相比,GMP活性下降,在该突变体中转入GMP基因能够使突变体抗坏血酸的含量恢复到野生型。在马铃薯中利用反义抑制技术降低GMP的酶活,转基因马铃薯移栽大田后叶脉和茎上出现深色斑点。在抗坏血酸含量降低最多的系中,植株地上部分在3个月后就枯萎死亡,而野生型马铃薯未出现衰老现象。

目前已从很多植物中克隆得到GMP基因,如拟南芥、大豆、猕猴桃、番茄等。茄子是重要的蔬菜作物,但其因为缺少基因组相关信息,导致相关研究比较滞后。目前,未有任何与茄子GMP基因及其编码蛋白的相关文献报道。

发明内容

本发明的目的在于填补茄子GMP蛋白及其编码基因的空白。本发明提供了一种茄子GMP的cDNA以及氨基酸序列;进一步地,本发明提供了茄子SmGMP基因在不同组织器官及低温下的表达模式。

本发明的目的是通过以下技术方案实现的:

第一方面,本发明提供一种具有茄子甘露糖焦磷酸化酶(GMP)活性的蛋白质,所述蛋白质包括:

(a)由如SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;或

(b)在(a)中的氨基酸序列经过取代、缺失或者添加一个或几个氨基酸且具有茄子甘露糖焦磷酸化酶(GMP)活性的由(a)衍生的蛋白质;

该蛋白质在茄子不同器官内的有无及活性大小存在较大差异。

优选地,所述蛋白质包括SEQ ID NO.2所示氨基酸序列经过1~50个氨基酸的缺失、插入和/或取代,或者在C末端和/或N末端添加1~20个以内氨基酸而得到的序列。

优选地,所述蛋白质为SEQ ID NO.2所示氨基酸序列中1~10个氨基酸被性质相似或相近的氨基酸所替换而形成的序列。

第二方面,本发明提供了一种编码所述具有茄子甘露糖焦磷酸化酶(GMP)活性的蛋白质的基因的核酸序列,所述基因的核酸序列如SEQ ID NO.1所示。

优选的,所述基因的核酸序列包括:

(a)如SEQ ID NO.1第1~1086位所示的碱基序列;或

(b)与SEQ ID NO.1第1~1086位所示的碱基序列具有至少70%的同源性的碱基序列;或

(c)能与SEQ ID NO.1第1~1086位所示的碱基序列进行杂交的碱基序列。

优选的,所述核酸序列包括SEQ ID NO.1第1~1086位所示的核酸序列中1~90个核苷酸的缺失、插入和/或取代,以及在5′和/或3′端添加60个以内核苷酸形成的碱基序列。

第三方面,本发明提供一对用于扩增所述基因的核酸序列的cDNA的引物对,所述引物对的序列如SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5所示。

第四方面,本发明还提供一种所述基因的核酸序列的启动子,所述启动子包括SEQ ID NO.3所示的碱基序列。

在本发明中,“分离的DNA”、“纯化的DNA”是指,该DNA或片段已从天然状态下位于其两侧的序列中分离出来,还指该DNA或片段已经与天然状态下伴随核酸的组分分开,而且已经与在细胞中相伴随的蛋白质分开。

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