[发明专利]茄子GDP-L-半乳糖磷酸酶SmGGP蛋白及其编码基因在审
申请号: | 201510333429.7 | 申请日: | 2015-06-16 |
公开(公告)号: | CN104974992A | 公开(公告)日: | 2015-10-14 |
发明(设计)人: | 陈火英;蒋明敏;刘杨;任丽;葛海燕 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12N9/12 | 分类号: | C12N9/12;C12N15/54;C12N15/11;C12N15/113 |
代理公司: | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人: | 郭国中;陈少凌 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 茄子 gdp 半乳糖 磷酸酶 smggp 蛋白 及其 编码 基因 | ||
技术领域
本发明涉及茄子抗坏血酸合成途径中的关键酶及其编码基因,具体涉及一种茄子GDP-L-半乳糖磷酸酶SmGGP蛋白及其编码基因,属于生物技术领域。
背景技术
抗坏血酸是植物体内最重要的抗氧化物质之一,它可以直接清除植物在逆境或正常代谢中产生的活性氧。其次,抗坏血酸能够维持另一种重要的抗氧化剂维生素E处于还原状态,并通过抗坏血酸-谷胱甘肽循环间接清除H2O2,从而保护植物免于氧化胁迫的伤害。
目前为止,植物中抗坏血酸的生物合成被认为有4种途径,其中受公众认可的是L-半乳糖途径。GGP(GDP-L-galactose phosphorylase),又称为VTC2,催化GDP-L-半乳糖转变成L-半乳糖-1-磷酸。Bulley等研究发现猕猴桃叶片及不同发育时期果实中抗坏血酸的含量与GGP基因的表达呈现很好的相关性。在抗坏血酸含量最高的毛花猕猴桃中,GME和GGP的表达高于其他种的猕猴桃。在拟南芥中超量表达来自猕猴桃的GGP基因可使抗坏血酸的含量提高4倍左右,而当同时瞬时表达GME和GGP基因可以使抗坏血酸的含量增加至7倍。这些结果说明了GGP基因很可能是调控植物抗坏血酸合成的关键点。
目前已从很多植物中克隆得到GGP基因,如拟南芥、大豆、猕猴桃、番茄等。茄子是重要的蔬菜作物,但其因为缺少基因组相关信息,导致相关研究比较滞后。目前,未有任何与茄子GGP基因及其编码蛋白的相关文献报道。
发明内容
本发明的目的在于填补茄子GGP蛋白及其编码基因的空白,提供了一种茄子GGP的cDNA以及氨基酸序列;进一步地,本发明提供了茄子SmGGP基因在不同组织器官及低温下的表达模式。
本发明的目的是通过以下技术方案实现的:
第一方面,本发明提供一种具有茄子GDP-L-半乳糖磷酸酶(GGP)活性的蛋白质,所述蛋白质包括:
(a)由如SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;或
(b)在(a)中的氨基酸序列经过取代、缺失或者添加一个或几个氨基酸且具有茄子GGP活性的由(a)衍生的蛋白质;
该蛋白质在茄子不同器官内的有无及活性大小存在较大差异。
优选地,所述蛋白质包括SEQ ID NO.2所示氨基酸序列经过1~50个氨基酸的缺失、插入和/或取代,或者在C末端和/或N末端添加1~20个以内氨基酸而得到的序列。
优选地,所述蛋白质为SEQ ID NO.2所示氨基酸序列中1~10个氨基酸被性质相似或相近的氨基酸所替换而形成的序列。
第二方面,本发明提供了一种编码所述具有茄子GDP-L-半乳糖磷酸酶(GGP)活性的蛋白质的基因的核酸序列,所述基因的cDNA序列如SEQ ID NO.1所示。
优选的,所述基因的cDNA序列包括:
(a)如SEQ ID NO.1第1~1314位所示的碱基序列;或
(b)与SEQ ID NO.1第1~1314位所示的碱基序列具有至少70%的同源性的碱基序列;或
(c)能与SEQ ID NO.1第1~1314位所示的碱基序列进行杂交的碱基序列。
优选的,所述核酸序列包括SEQ ID NO.1第1~1314位所示的核酸序列中1~90个核苷酸的缺失、插入和/或取代,以及在5′和/或3′端添加60个以内核苷酸形成的碱基序列。
第三方面,本发明提供一对用于扩增所述基因的核酸序列的cDNA的引物,所述引物的序列如SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示。
第四方面,本发明还提供一种所述基因的核酸序列的启动子,所述启动子包括SEQ ID NO.3所示的碱基序列。
在本发明中,“分离的DNA”、“纯化的DNA”是指,该DNA或片段已从天然状态下位于其两侧的序列中分离出来,还指该DNA或片段已经与天然状态下伴随核酸的组分分开,而且已经与在细胞中相伴随的蛋白质分开。
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