[发明专利]与桃果形圆、扁性状连锁的SNP位点、基于该位点的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了与桃果形圆、扁性状连锁的SNP位点、基于该位点的分子标记及其应用，所述的SNP位点位于基因PPa003772mg的2453bp处，序列编码方向为5’——3’方向。所述SNP位点恰好位于所述的AS‑PCR分子标记的下游R引物的最后一个3’端碱基处，同时错配3’端第二位的碱基，由胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸T变为鸟嘌呤脱氧核糖核苷酸G。通过以上方法，在蟠桃、普通桃的选育工作中，可以显著降低桃树育种的工作量，缩短育种时间，极大地提高育种效率。

技术领域

本发明属于基因工程技术领域，涉及一种与桃果形圆、扁性状连锁的SNP位点、基于该位点的分子标记及其应用。

背景技术

桃为蔷薇科李属桃亚属多年生落叶果树，其果实柔软多汁，风味宜人，为大众喜爱的果品。桃果实营养价值高，既富含多糖果胶质又含多种维生素和矿质元素，是老少皆宜的水果。

目前，桃果实从果形上主要分为两种：扁平的蟠桃和圆形的普通桃。每一种类型都有相应的消费群体以及重要的利用价值，但是对如今的桃产业体系来说，品质优良的品种仍旧很少。培育高品质的蟠桃、普通桃成为当下急需解决的问题。

目前，育种家在桃育种工作中主要采用的是传统的杂交选育新品种的方法，该方法育种周期长，占地面积大，耗时耗力，而且育种效率低。对普通桃、蟠桃的选育更是如此，育种早起根本无法区分普通桃与蟠桃性状。

而且，桃树育种工作中没有一种有效准确的分子标记用于普通桃、蟠桃的选育，育种家只能等到树体达到具有开花结果能力之后进行选择，因而培育普通桃与蟠桃工作花费的时间长、工作量大、效率低。

然而，随着消费者需求的不断提高，如何快速高效地培育风味更好、品质更优的普通桃与蟠桃品种成为现在育种家面临的严峻挑战。目前急需一种准确高效的分子标记，利用分子标记辅助选择育种技术，快速提高普通桃与蟠桃的选育效率，加速育种进程，加速中国桃产业的发展。

发明内容

为了解决现有技术中存在的技术问题，本发明提供了一种与桃果形圆、扁性状连锁的SNP位点、基于该位点的分子标记及其应用。

本发明的目的之一在于提供一种与普通桃、蟠桃果形性状连锁的SNP(单核苷酸多态性)位点。

本发明的目的之二在于提供一种基于该SNP位点开发的一种与普通桃、蟠桃两种果形性状显著相关的AS-PCR分子标记及用于扩增该标记的引物对。

本发明的目的之三在于提供以上所述的SNP位点以及基于该位点的AS-PCR分子标记及其在普通桃、蟠桃的选育工作中的应用。

其技术方案如下：

1、本发明所提及的SNP位点，位于桃基因组第6号染色体上，所属基因的基因名称为PRUPE_ppa003772mg，该SNP位于该基因的第2453碱基处，该处的碱基为腺嘌呤脱氧核糖核苷酸(A)或者胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸(T)，该SNP位点与桃果形的圆、扁性状连锁。

2、本发明中是利用该SNP位点，成功将其转化为基于PCR的AS-PCR标记，扩增产物长度345bp左右。扩增该AS-PCR标记的引物对如表1：

表1

3、利用该SNP转化的AS-PCR分子标记，即可通过简单的PCR、琼脂糖电泳操作，实现对蟠桃与普通桃的准确区分，成功地将分子标记辅助选择育种技术应用于现实的桃育种工作中。

与现有技术相比，本发明的有益效果：通过以上方法，在蟠桃、普通桃的选育工作中，可以显著降低桃树育种的工作量，缩短育种时间，极大地提高育种效率。

具体实施方式

下面结合具体实施例进一步说明本发明的技术方案。