[发明专利]河八王的一种DNA指纹图谱及其获取方法与专用引物有效
申请号: | 201510415576.9 | 申请日: | 2015-07-15 |
公开(公告)号: | CN105018481B | 公开(公告)日: | 2018-06-26 |
发明(设计)人: | 刘昔辉;李杨瑞;区惠平;张荣华;周会;张革民;杨丽涛;宋焕忠;杨柳;李长宁;张保青;宋修鹏 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区农业科学院甘蔗研究所;广西大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12N15/10;C12Q1/6895 |
代理公司: | 深圳市科吉华烽知识产权事务所(普通合伙) 44248 | 代理人: | 胡吉科 |
地址: | 530007 广西*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 专用引物 引物 鉴别 基因组DNA 遗传改良 指纹图谱 种质资源 唯一性 多态性 构建 谱带 种质 甘蔗 | ||
1.一种获取河八王DNA指纹图谱的方法,包括如下步骤:
步骤S1:提取河八王的基因组DNA;
步骤S2:采用内切酶
步骤S3:将所述酶切产物连接上接头引物进行扩增,得到连接产物;所述接头引物为SEQ NO:7和SEQ NO:8,SEQ NO:9和SEQ NO:10;
步骤S4:预扩增反应,采用预扩增引物对所述连接产物进行预扩增反应,其中,所述预扩增引物为SEQ NO:11和SEQ NO:12;
步骤S5:选择性扩增反应,采用引物对Narenga 1、引物对Narenga 2和引物对Narenga3进行选择性扩增,得到AFLP扩增产物;
所述Narenga 1是序列表的SEQ NO:1和SEQ NO:2组成的引物对;
所述Narenga 2是序列表的SEQ NO:3和SEQ NO:4组成的引物对;
所述Narenga 3是序列表的SEQ NO:5和SEQ NO:6组成的引物对;
步骤S6:对所述AFLP扩增产物进行毛细管电泳检测扩增产物,分离DNA 标记,显示河八王的DNA指纹图谱。
2.根据权利要求1所述的获取河八王DNA指纹图谱的方法,其特征在于:步骤S4中,所述预扩增反应程序为预变性94℃ 30 s,56℃退火30 s,72℃延伸80 s,循环30次。
3.根据权利要求2所述的获取河八王DNA指纹图谱的方法,其特征在于:所述预扩增反应体系为:10 ng/µl的DNA 2µl,Pre-ampmix 1 µl,2.5 mM dNTPs 0.5 µl,10 × PCRbuffer 2.5 µl,Taq DNA polymease 0.5 µl,ddH2O 18.5 µl;
4.根据权利要求1所述的获取河八王DNA指纹图谱的方法,其特征在于:步骤S5中,所述选择性扩增反应程序为预变性94℃ 30 s,65℃退火30 s,72℃延伸80 s,1个循环;然后以每循环复性温度逐级降低 0.7 ℃梯度进行14个循环;最后以94℃变性30 s,55℃退火30s,72℃延伸80 s,循环23次。
5.根据权利要求4所述的获取河八王DNA指纹图谱的方法,其特征在于:所述选择性扩增反应体系为:预扩增稀释样品2 µl,10 × PCR buffer 2.5 µl,2.5 mM dNTPs 0.5 μl,正向引物10 mM 1 µl,反向引物10 mM 1 µl,Taq DNA polymease 0.5 µl,ddH2O 17.5 µl。
6.根据权利要求1~5任意一项所述的获取河八王DNA指纹图谱的方法,其特征在于:所述河八王的基因组DNA来自河八王的任何部位。
7.根据权利要求6所述的获取河八王DNA指纹图谱的方法,其特征在于:所述河八王的基因组DNA来自河八王的叶片。
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