[发明专利]肺鳞癌中DNAH5融合基因及其用途

权利要求书

1.一种检测试剂，其特征在于，所述的检测试剂用于检测SEQ ID No:1所示的TRA2B-DNAH5融合蛋白的核苷酸序列，所述的检测试剂包括：

(i)一上游引物和一下游引物(引物对)，

其中，所述上游引物结合于TRA2B蛋白的片段的编码区或其上游的5’UTR序列；

所述下游引物结合于DNAH5蛋白的片段的编码区或其下游的3’UTR序列，所述的上游引物结合于SEQ ID NO.:1中第1-312位所示的核苷酸序列；所述的下游引物结合于SEQ IDNO.:1中第313-13281位所示的核苷酸序列；和

(ii)任选的特异性探针。

2.如权利要求1所述的检测试剂，其特征在于，上游引物的序列如SEQ ID NO.:5所示；下游引物的序列如SEQ ID NO.:6所示；和/或探针如SEQ ID NO.:3所示。

3.一种权利要求1所述的检测试剂的用途，其特征在于，用于制备一试剂盒，所述试剂盒用于(i)检测待测样本中TRA2B-DNAH5基因是否融合和/或确认TRA2B-DNAH5基因的融合位点；(ii)对肺鳞癌病人进行分型；和/或(iii)判断肺鳞癌病人是否适合用TRA2B-DNAH5基因或蛋白的抑制剂进行治疗。

4.如权利要求3所述的用途，其特征在于，如果待测样本的融合基因TRA2B-DNAH5 mRNA的量A高于对照值C，则适合对该肺鳞癌病人用TRA2B-DNAH5基因或蛋白的抑制剂进行治疗；所述对照值C为不存在融合基因TRA2B-DNAH5的肺鳞癌病人中的检测值，其中，对照值C为0。

5.一种含有权利要求1所述检测试剂的试剂盒。

6.如权利要求5所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还含有一融合蛋白、或含有SEQID NO.:4所示氨基酸序列的短肽，所述融合蛋白或所述短肽作为阳性对照，其中，所述融合蛋白是由TRA2B蛋白的片段与DNAH5蛋白的片段构成的融合蛋白，其中，TRA2B蛋白的片段来自TRA2B蛋白的N端序列并且位于所述融合蛋白的N端；而所述的DNAH5蛋白的片段来自于DNAH5蛋白并且位于所述融合蛋白的C端。

7.如权利要求6所述的试剂盒，其特征在于，所述的融合蛋白中含有以下特征性序列：

SEQ ID NO.:2中第9-16位所示的氨基酸序列；

SEQ ID NO.:2第4-20位所示的氨基酸序列；或

SEQ ID NO.:2第1-24位所示的氨基酸序列。

8.如权利要求6所述的试剂盒，其特征在于，所述的TRA2B蛋白的片段的序列为SEQ IDNO.:2中第1-12位所示。

9.如权利要求6所述的试剂盒，其特征在于，所述的DNAH5蛋白的片段的序列为SEQ IDNO.:2中第13-3777位所示。

10.如权利要求6所述的试剂盒，其特征在于，所述融合蛋白的结构如式II所示：

A2-B2 (式II)

式中，

A2为来自TRA2B蛋白的N端的氨基酸序列，

B2为来自DNAH5蛋白的C端的氨基酸序列；

“-”为位于元件A2和元件B2之间的肽键。

11.如权利要求6所述的试剂盒，其特征在于，所述融合蛋白选自下组：

(A)具有SEQ ID NO:2所示氨基酸序列的多肽。