[发明专利]蛋白质组数据库及其应用

权利要求书

1.一种构建蛋白质组数据库的方法，其特征在于，包括以下步骤：

接收多个蛋白序列；

消除每个所述蛋白序列的起始氨基酸，获得相应的截断序列；

建立数据表，以获得所述蛋白质组数据库，

所述数据表包含多个记录，一个所述记录与一个所述截断序列对应，

所述数据表包含多个字段，所述字段包括以下序列参数中的至少两种：氨基酸丰度、序列长度、序列分子量、序列疏水性和序列等电点，

所述氨基酸丰度包括以下至少之一：Ala丰度、Cys丰度、Asp丰度、Glu丰度、Phe丰度、Gly丰度、His丰度、Ile丰度、Lys丰度、Leu丰度、Met丰度、Asn丰度、Pro丰度、Gln丰度、Arg丰度、Ser丰度、Thr丰度、Val丰度、Trp丰度和Tyr丰度。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述字段包括所述序列参数中的至少三种。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述字段包括所述序列参数中的至少四种。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述字段包括全部所述序列参数。

5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述字段还包括蛋白名称、氨基酸序列和/或蛋白登录号。

6.根据权利要求1-5任一所述的方法，其特征在于，所述字段包括所述序列长度，所述序列长度分为五个分量：[0,200)，[200,500)，[500,1000)，[1000,2000)和大于等于2000氨基酸(aa)。

7.根据权利要求1-5任一所述的方法，其特征在于，所述字段包括所述序列分子量，所述序列分子量分为五个分量：[0,23000)，[23000,57500)，[57500,115000)，[115000,230000)和大于等于230000道尔顿(Da)。

8.根据权利要求1-5任一所述的方法，其特征在于，所述字段包括所述序列等电点，所述序列等电点分为五个分量：[0,4.0)，[4.0,6.0)，[6.0,8.0)，[8.0,10.0)和大于等于10.0。

9.根据权利要求1-5任一所述的方法，其特征在于，所述字段包括所述序列疏水性，所述序列疏水性分为五个分量：小于-1.0，[-1.0,-0.5)，[-0.5,0.0)，[0.0,0.5)和大于等于0.5。

10.根据权利要求1-5任一所述的方法，其特征在于，所述字段包括所述氨基酸丰度，所述氨基酸丰度分为五个分量：[0.0,0.05)，[0.05,0.1)，[0.1,0.15)，[0.15,0.20)和[0.20,1]。

11.一种蛋白质组数据库，其根据权利要求1-10任一所述的方法构建获得。

12.根据权利要求11所述的蛋白质组数据库，其特征在于，其中的数据表的字段包括氨基酸丰度，所述数据表的记录按照所述氨基酸丰度的大小排布。

13.根据权利要求11所述的蛋白质组数据库，其特征在于，其中的数据表的字段包括序列等电点，所述数据库的记录按照所述序列等电点的大小排布。

14.根据权利要求11所述的蛋白质组数据库，其特征在于，其中的数据表的字段包括序列疏水性，所述数据库的记录按照所述序列疏水性的大小排布。

15.根据权利要求11所述的蛋白质组数据库，其特征在于，其中的数据表的字段包括序列分子量，所述数据库的记录按照所述序列分子量的大小排布。

16.根据权利要求11所述的蛋白质组数据库，其特征在于，其中的数据表的字段包括蛋白质名称，所述数据库的记录按照所述蛋白质名称的字母顺序排布。

17.权利要求11-16任一所述的蛋白质组数据库在蛋白质分类和/或检索定位中的用途。

18.一种定位蛋白的方法，其特征在于，根据所述蛋白的序列参数在权利要求11-16任一所述的蛋白质组数据库中的位置，以实现所述定位，

所述序列参数与所述蛋白质组数据库中的数据表的字段相对应。