[发明专利]一种快速检测灰葡萄孢菌对SDHI类杀菌剂抗性的方法及引物组合物有效
申请号: | 201510450026.0 | 申请日: | 2015-07-28 |
公开(公告)号: | CN105063187B | 公开(公告)日: | 2017-12-05 |
发明(设计)人: | 段亚冰;周明国;陈长军;杨莹;王建新;张晓柯 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/18;C12N15/11 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 210095 江苏省南*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 检测 葡萄 sdhi 杀菌剂 抗性 方法 引物 组合 | ||
1.用于检测灰葡萄孢菌对SDHI类杀菌剂抗性的LAMP引物组合物:由SEQ ID NO.2所示的正向内引物FIP、SEQ ID NO.3所示的反向内引物BIP、SEQ ID NO.4所示的正向外引物F3、SEQ ID NO.5所示的反向外引物B3、SEQ ID NO.6所示的环引物LF组成。
2.一种检测灰葡萄孢菌对SDHI类杀菌剂抗性的LAMP检测方法,步骤为:
(1)运用权利要求1所述的两对特异性引物对待测样品的基因组DNA进行LAMP恒温扩增,反应体系为10μL,包括240U/mL Bst DNA聚合酶,20 mM Tris-HCl,10 mM KCl,10mM(NH4)2SO4,2mM MgSO4,0.1%Triton X-100,2.0mM MgCl2,0.6mM dNTPs,0.32M甜菜碱,0.2mM羟基溴酚蓝(HNB),0.8μM正向内引物FIP,0.8μM反向内引物BIP,0.2μM正向外引物F3,0.2μM反向外引物B3,0.4μM环引物LF,加入无菌超纯水;反应参数为59-61℃ 60min,80℃ 10min;
(2)对上述LAMP扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,在紫外光下检测结果,若存在梯状条带,则证明所检测灰葡萄孢菌为灰葡萄孢菌对SDHI类杀菌剂272位抗性突变型菌株;若无梯状条带,则证明所检测灰葡萄孢菌为非272位抗性突变型菌株;或观察LAMP反应溶液颜色变化,若为天蓝色,判定为灰葡萄孢菌对SDHI类杀菌剂272位抗性突变型菌株,若为紫色,判定为非272位抗性突变型菌株。
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