[发明专利]用于小鼠近交系鉴定的SNP标记、引物对及其应用有效
申请号: | 201510469373.8 | 申请日: | 2015-07-31 |
公开(公告)号: | CN104975105B | 公开(公告)日: | 2018-04-13 |
发明(设计)人: | 杜红丽;关宇佳;李舸;张钰;张燕宇 | 申请(专利权)人: | 华南理工大学;广东省实验动物监测所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司44245 | 代理人: | 苏运贞 |
地址: | 510006 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 小鼠 近交系 鉴定 snp 标记 引物 及其 应用 | ||
1.一种用于小鼠近交系鉴定的SNP标记在小鼠近交系的鉴定中的应用,其特征在于所述的SNP标记由7个SNP位点组成,为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6和SNP7;
所述的SNP1表示该SNP位点位于SEQ ID NO:15所示的核苷酸序列的第91位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K;
所述的SNP2表示该SNP位点位于SEQ ID NO:16所示的核苷酸序列的第196位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基M;
所述的SNP3表示该SNP位点位于SEQ ID NO:17所示的核苷酸序列的第112位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;
所述的SNP4表示该SNP位点位于SEQ ID NO:18所示的核苷酸序列的第294位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;
所述的SNP5表示该SNP位点位于SEQ ID NO:19所示的核苷酸序列的第188位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;
所述的SNP6表示该SNP位点位于SEQ ID NO:20所示的核苷酸序列的第244位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;
所述的SNP7表示该SNP位点位于SEQ ID NO:21所示的核苷酸序列的第217位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;
所述的小鼠近交系为129、C3H、BALB、C57BL、CBA、DBA、FVB和ICR中的至少一种。
2.一种用于小鼠近交系鉴定的SNP标记在制备试剂盒或检测方法中的应用,其特征在于:所述的试剂盒或检测方法的用途为小鼠近交系鉴定或物种鉴定;
所述的SNP标记由7个SNP位点组成,为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6和SNP7;
所述的SNP1表示该SNP位点位于SEQ ID NO:15所示的核苷酸序列的第91位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K;
所述的SNP2表示该SNP位点位于SEQ ID NO:16所示的核苷酸序列的第196位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基M;
所述的SNP3表示该SNP位点位于SEQ ID NO:17所示的核苷酸序列的第112位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;
所述的SNP4表示该SNP位点位于SEQ ID NO:18所示的核苷酸序列的第294位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;
所述的SNP5表示该SNP位点位于SEQ ID NO:19所示的核苷酸序列的第188位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;
所述的SNP6表示该SNP位点位于SEQ ID NO:20所示的核苷酸序列的第244位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;
所述的SNP7表示该SNP位点位于SEQ ID NO:21所示的核苷酸序列的第217位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y;
所述的小鼠近交系为129、C3H、BALB、C57BL、CBA、DBA、FVB和ICR中的至少一种。
3.一种用于小鼠近交系鉴定的引物对,其特征在于:包括引物对SNP1F/R、引物对SNP2F/R、引物对SNP3F/R、引物对SNP4F/R、引物对SNP5F/R、引物对SNP6F/R和引物对SNP7F/R;
引物对SNP1F/R的序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示;
引物对SNP2F/R的序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示;
引物对SNP3F/R的序列如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示;
引物对SNP4F/R的序列如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示;
引物对SNP5F/R的序列如SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10所示;
引物对SNP6F/R的序列如SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12所示;
引物对SNP7F/R的序列如SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14所示;
所述的小鼠近交系为129、C3H、BALB、C57BL、CBA、DBA、FVB和ICR中的至少一种。
4.利用权利要求3所述的引物对扩增得到的DNA序列的组合,其特征在于:所述的DNA序列如SEQ ID NO:15~SEQ ID NO:21所示。
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