[发明专利]一种圆口铜鱼微卫星标记及其应用

权利要求书

1.圆口铜鱼微卫星标记，其特征在于：

其核苷酸序列分别如SEQIDNO：1-8所示，或

其核苷酸序列与1）中的核苷酸序列互补。

2.用于扩增权利要求1所述的圆口铜鱼微卫星标记的引物对，所述的引物对设计参数为：引物长度17-25bp，PCR产物片段长度范围100-350bp，最适退火温度55-65℃，GC含量在40%-60%之间。

3.用于扩增权利要求1所述的圆口铜鱼微卫星标记的引物对，其特征在于：其上下游引物的核苷酸序列分别如SEQIDNO：9、SEQIDNO：10所示，其扩增核苷酸序列如SEQIDNO：1所示的微卫星标记；其上下游序列分别如SEQIDNO：11、SEQIDNO：12所示，其扩增核苷酸序列如SEQIDNO：2所示的微卫星标记；其上下游序列分别如SEQIDNO：13、SEQIDNO：14所示，其扩增核苷酸序列如SEQIDNO：3所示的微卫星标记；其上下游序列分别如SEQIDNO：15、SEQIDNO：16所示，其扩增核苷酸序列如SEQIDNO：4所示的微卫星标记；其上下游序列分别如SEQIDNO：17、SEQIDNO：18所示，其扩增核苷酸序列如SEQIDNO：5所示的微卫星标记；其上下游序列分别如SEQIDNO：19、SEQIDNO：20所示，其扩增核苷酸序列如SEQIDNO：6所示的微卫星标记；其上下游序列分别如SEQIDNO：21、SEQIDNO：22所示，其扩增核苷酸序列如SEQIDNO：7所示的微卫星标记；和/或，其上下游序列分别如SEQIDNO：23、SEQIDNO：24所示，其扩增核苷酸序列如SEQIDNO：8所示的微卫星标记。

4.使用权利要求2或3所述的引物对检测圆口铜鱼种群遗传多样性的方法，包括如下步骤：

（1）提取圆口铜鱼基因组DNA；

（2）微卫星PCR扩增：采用经荧光标记的权利要求2或3所述的引物对，以圆口铜鱼基因组DNA为模板进行PCR，获得圆口铜鱼个体微卫星扩增产物；

（3）测序仪检测扩增产物：将扩增产物避光保存，用ABI3730XL测序仪进行毛细管电泳和STR分析；

（4）遗传多样性分析：根据每个圆口铜鱼个体的微卫星扩增产物的分子量大小确定基因型，采用GENEPOP4.0.10计算遗传多样性参数；

优选地，步骤（1）采用酚-氯仿法提取圆口铜鱼鳍条组织的基因组DNA。

5.权利要求1所述的微卫星标记或权利要求2或3所述的引物对在检测圆口铜鱼种群遗传多样性中的应用。

6.权利要求1所述的微卫星标记或权利要求2或3所述的引物对在分析圆口铜鱼亲缘关系中的应用。

7.权利要求1所述的微卫星标记或权利要求2或3所述的引物对在圆口铜鱼辅助育种中的应用。