[发明专利]用于七种猪病病原鉴定的基因芯片及其检测方法在审

专利信息
申请号: 201510479684.2 申请日: 2015-08-07
公开(公告)号: CN105063760A 公开(公告)日: 2015-11-18
发明(设计)人: 聂福平;王昱;杨俊;李应国;王国民;保雨;艾军;李贤良;张强 申请(专利权)人: 重庆出入境检验检疫局检验检疫技术中心
主分类号: C40B40/06 分类号: C40B40/06;C12Q1/70;C12Q1/68;C12Q1/04
代理公司: 重庆市恒信知识产权代理有限公司 50102 代理人: 刘小红;李金蓉
地址: 400020*** 国省代码: 重庆;85
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摘要:
搜索关键词: 用于 种猪 病原 鉴定 基因芯片 及其 检测 方法
【权利要求书】:

1.用于七种猪病病原鉴定的基因芯,包括:PCR反应混合液、Taq聚合酶、PCR阳性对照、PCR阴性对照、ddH2O、检测芯片、芯片探针的点样分布、芯片盖片、杂交液、杂交阳性对照、杂交盒,采用基因芯片微量点样技术,将待测样品探针与各种质控探针固定在经过化学修饰的基片上,形成的微阵列,其特征在于:所述微阵列包括质控探针区和待测样品探针区,其中所述质控探针区内设置下述分区:

点样位置质控分区(P1),包含至少一个点样位置质控探针:SEQIDNO.8;

杂交阳性质控分区(P2),包含至少一个杂交阳性质控探针:SEQIDNO.9;

杂交阴性质控分区(N),包含点样缓冲液;

所述待测样品探针区内设置下述至少一个待测样品探针的分区:

猪传染性胸膜肺炎放线杆菌探针分区(1),

副猪嗜血杆菌探针分区(2),

猪肺炎支原体探针分区(3),

猪圆环病毒2型探针分区(4),

猪繁殖与呼吸综合征病毒探针分区(5),

猪瘟病毒探针分区(6),

猪传染性胃肠炎病毒探针分区(7).

各个探针序列如下:

猪传染性胸膜肺炎放线杆菌探针:SEQIDNO.1;

副猪嗜血杆菌探针:SEQIDNO.2;

猪肺炎支原体探针:SEQIDNO.3;

猪圆环病毒2型探针:SEQIDNO.4;

猪繁殖与呼吸综合征病毒探针:SEQIDNO.5;

猪瘟病毒探针:SEQIDNO.6;

猪传染性胃肠炎病毒探针:SEQIDNO.7。

2.根据权利要求1所述用于七种猪病病原鉴定的基因芯,其特征在于:每张所述检测芯片上包括至少一个权利要求1所述的微阵列,每个微阵列可以检测一份样品。

3.根据权利要求1所述用于七种猪病病原鉴定的基因芯,其特征在于:所述每条质控探针和待测样品探针的5′端均通过15个胸腺嘧啶核苷酸连接有一个氨基。

4.利用权利要求1所述基因芯片检测猪传染性胸膜肺炎放线杆菌、副猪嗜血杆菌、猪肺炎支原体、猪圆环病毒2型、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒和猪传染性胃肠炎病毒的非疾病目的的检测方法,包括如下步骤:

(1)待测样品制备:按照商品化DNA/RNA提取试剂盒使用说明书提取待测样品全基因组DNA/RNA,制备待测样品DNA/cDNA;

(2)PCR扩增:25μLPCR反应液包含:rTaq酶12.5μL、引物Mix:3.1μL、待测样品DNA/cDNA5μL、无核酸酶灭菌水4.4μL;

其中,所述引物Mix含有:

序列为SEQIDNO.10的10μmol/L猪传染性胸膜肺炎放线杆菌上游引物0.05μL,

序列为SEQIDNO.11的10μmol/L猪传染性胸膜肺炎放线杆菌下游引物0.05μL,

序列为SEQIDNO.12的10μmol/L副猪嗜血杆菌上游引物0.1μL,

序列为SEQIDNO.13的10μmol/L副猪嗜血杆菌下游引物0.1μL,

序列为SEQIDNO.14的10μmol/L猪肺炎支原体上游引物0.1μL,

序列为SEQIDNO.15的10μmol/L猪肺炎支原体下游引物0.1μL,

序列为SEQIDNO.16的10μmol/L猪圆环病毒2型上游引物0.05μL,

序列为SEQIDNO.17的10μmol/L猪圆环病毒2型下游引物0.05μL,

序列为SEQIDNO.18的10μmol/L猪繁殖与呼吸综合征病毒上游引物0.1μL,

序列为SEQIDNO.19的10μmol/L猪繁殖与呼吸综合征病毒下游引物0.1μL,

序列为SEQIDNO.20的10μmol/L猪瘟病毒上游引物0.05μL,

序列为SEQIDNO.21的10μmol/L猪瘟病毒下游引物0.05μL,

序列为SEQIDNO.22的10μmol/L猪传染性胃肠炎病毒上游引物0.1μL,

序列为SEQIDNO.23的10μmol/L猪传染性胃肠炎病毒下游引物0.1μL

序列为SEQIDNO.24的20μmol/L通用引物上游引物1μL,

序列为SEQIDNO.25的20μmol/L通用引物下游引物1μL.

按如下步骤进行扩增:94℃5min;94℃30sec,56℃30sec,72℃25sec循环12次;94℃30sec,50℃30sec,72℃25sec循环30次;72℃5min;

(3)杂交:首先配制杂交液,包括杂交缓冲液7.9μL、PCR扩增产物8μL、杂交阳性对照0.1μL,混匀后95℃变性8min,冰上放置5min,然后取其中15μL杂交液进行杂交;

(4)结果判读:用微阵列芯片扫描仪扫描分析,去除阴性对照背景,与芯片杂交说明对照,判定结果。

5.根据权利要求4所述检测方法,其特征是:所述杂交缓冲液每1000μL包括20×SSC500μL、10%SDS10μL及DEPCH2O490μL。

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