[发明专利]一种单分子定位装置在审
申请号: | 201510483297.6 | 申请日: | 2015-08-07 |
公开(公告)号: | CN105303552A | 公开(公告)日: | 2016-02-03 |
发明(设计)人: | 葛良进;曾健明;曾立董 | 申请(专利权)人: | 深圳市瀚海基因生物科技有限公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/60 |
代理公司: | 广州三环专利代理有限公司 44202 | 代理人: | 郝传鑫;熊永强 |
地址: | 518000 广东省深圳市南山区西丽街道*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 分子 定位 装置 | ||
技术领域
本发明涉及计算机技术领域,尤其涉及一种单分子定位装置。
背景技术
近年来,超分辨荧光成像技术实现了在分子水平下对活细胞精细结构的观察,成为生物结构和功能成像极其重要的工具,并成为单分子测序技术必不可少的一部分。超分辨荧光成像技术是以纳米级的空间分辨率直观地显示单分子的空间分布情况的技术。超分辨荧光成像能用来研究被荧光分子标记的单分子之间的相互作用过程,可用于单分子测序技术中判断碱基的延伸情况。目前常用的超分辨荧光成像方法是利用荧光分子本身的开关效应来进行定位的显微成像技术。例如,光敏定位显微(PALM)、随机光学重建显微(STORM)等等,它们在不同时刻获取稀疏分布的被荧光分子标记的单分子的定位信息,然后将不同时刻获得的定位信息叠加,最终实现高横向纳米分辨。一幅超分辨图像由若干单分子位置叠加获得。显然,单分子定位是超分辨荧光成像过程中不可缺少的一环节。因此,提供一种能够对单分子进行定位的装置非常重要。
发明内容
本发明实施例公开了一种单分子定位装置,能够对单分子进行定位。
本发明实施例公开了一种单分子定位装置,所述单分子定位装置包括:
确定模块,用于针对目标图片的每一像素点,确定与所述像素点对应的亮度值矩阵,所述亮度值矩阵为以所述像素点的亮度值为中心的拥有预设行数以及预设列数的像素点亮度值的矩阵;
获取模块,用于根据所述亮度值矩阵,获取所述目标图片的二值化矩阵;
所述确定模块,还用于从所述二值化矩阵中确定顶点值为1的第一连通分量;
计算模块,用于通过预设算法求取所述第一连通分量的中心坐标作为单分子的二维位置坐标。
在本发明实施例中,确定模块将针对目标图片的每一像素点,确定与该像素点对应的亮度值矩阵,该亮度值矩阵为以所述像素点的亮度值为中心的拥有预设行数以及预设列数的像素点亮度值的矩阵;获取模块根据亮度值矩阵,获取目标图片的二值化矩阵,确定模块从二值化矩阵中确定顶点值为1的第一连通分量;计算模块通过预设算法求取第一连通分量的中心坐标作为单分子的二维位置坐标。可见,本发明实施例能够对单分子进行定位。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例中的技术方案,下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1是本发明实施例公开的一种单分子定位方法的流程示意图;
图2是本发明实施例公开的另一种单分子定位方法的流程示意图;
图3是本发明实施例公开的另一种单分子定位方法的流程示意图;
图4是本发明实施例公开的一种单分子定位装置的结构示意图;
图5是本发明实施例公开的另一种单分子定位装置的结构示意图;
图6是本发明实施例公开的另一种单分子定位装置的结构示意图;
图7是本发明实施例公开的目标图片的像素点分布示意图。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
本发明实施例公开了一种单分子定位方法及单分子定位装置,能够对单分子进行定位。以下分别进行详细说明。
请参见图1,图1为本发明实施例公开的一种单分子定位方法的流程示意图。如图1所示,该单分子定位方法可以包括以下步骤。
S101、针对目标图片的每一像素点,确定与所述像素点对应的亮度值矩阵,所述亮度值矩阵为以所述像素点的亮度值为中心的拥有预设行数以及预设列数的像素点亮度值的矩阵。
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