[发明专利]同时对单细胞基因组和转录组构库及测序的方法基于单细胞整合基因组学的测序方法及应用有效
申请号: | 201510509535.6 | 申请日: | 2015-08-19 |
公开(公告)号: | CN105297142B | 公开(公告)日: | 2018-12-07 |
发明(设计)人: | 李周芳;贺建奎;王嫣;郭佳杰;张萌 | 申请(专利权)人: | 南方科技大学 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C12Q1/6869 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 郝传鑫;熊永强 |
地址: | 518000 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 同时 单细胞 基因组 转录 组构 方法 基于 整合 应用 | ||
1.一种同时构建单细胞基因组和转录组高通量测序文库的方法,其特征在于,包括如下步骤:
a)获取单细胞;
b)分离细胞核和细胞质;采用显微注射法对单个细胞进行核质分离;所述显微注射法中,微细管针的直径在0.5-5微米,抓针的直径在10-50微米;
c)单个细胞核全基因组扩增,获得基因组测序文库;
d)单个细胞去核细胞质全转录组扩增,获得转录组测序文库。
2.一种同时对单细胞基因组和转录组进行高通量测序的方法,其特征在于,包括如下步骤:对如权利要求1所得的基因组测序文库和转录组测序文库进行高通量测序,分别获得所述单细胞的基因组序列信息和转录组序列信息。
3.一种基于单细胞整合基因组学的测序方法,其特征在于,包括如下步骤:对如权利要求2所得的单细胞的基因组序列信息和转录组序列信息进行生物信息学分析。
4.一种基于单细胞整合基因组学的方法鉴定细胞亚克隆的方法,其特征在于,包括如下步骤:根据多个如权利要求3所得的生物信息学分析序列信息,鉴定细胞亚克隆。
5.如权利要求3所述的基于单细胞整合基因组学的测序方法在等位基因检测中的应用。
6.如权利要求3所述的基于单细胞整合基因组学的测序方法在基因表达检测中的应用。
7.如权利要求6所述的应用,其特征在于,所述基因为单等位基因。
8.如权利要求3所述的基于单细胞整合基因组学的测序方法在RNA编辑位点检测中的应用。
9.如权利要求1所述的同时构建单细胞基因组和转录组高通量测序文库的方法、或权利要求3所述的基于单细胞整合基因组学的测序方法在二代、下一代或单分子高通量测序中的应用。
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