[发明专利]一种鉴定或辅助鉴定马铃薯薯形的方法及其专用的引物对有效
申请号: | 201510511116.6 | 申请日: | 2015-08-19 |
公开(公告)号: | CN105063217B | 公开(公告)日: | 2018-03-02 |
发明(设计)人: | 金黎平;徐建飞;朱文文;李广存;庞万福;卞春松;段绍光;刘杰 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司11245 | 代理人: | 关畅,白艳 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 辅助 马铃薯 方法 及其 专用 引物 | ||
1.一种鉴定或辅助鉴定待测马铃薯薯形的方法,包括如下步骤:检测待测马铃薯的同源染色体上的目标基因的第805位脱氧核糖核苷酸是否为C、第896位脱氧核糖核苷酸是否为T和第1146位脱氧核糖核苷酸是否为A:
1)若待测马铃薯的至少一条同源染色体上的目标基因的第805位脱氧核糖核苷酸为C,且所述待测马铃薯的至少一条同源染色体上的目标基因的第896位脱氧核糖核苷酸为T,且所述待测马铃薯的至少一条同源染色体上的目标基因的第1146位脱氧核糖核苷酸为A,则待测马铃薯为或候选为圆薯形马铃薯;
2)若待测马铃薯的同源染色体上的目标基因不满足上述条件,则待测马铃薯为或候选为长薯形马铃薯;
所述目标基因的序列如序列表中序列3所示;
所述圆薯形马铃薯为块茎的最大纵轴的长度与最大横轴的长度的比值I<1.4的马铃薯;所述长薯形马铃薯为块茎的最大纵轴的长度与最大横轴的长度的比值I≥1.4的马铃薯;
所述纵轴为匍匐茎生长方向;
所述横轴为垂直于匍匐茎生长方向。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述检测待测马铃薯的同源染色体上的目标基因的第805位脱氧核糖核苷酸是否为C、第896位脱氧核糖核苷酸是否为T和第1146位脱氧核糖核苷酸是否为A的方法为直接测序。
3.一种鉴定或辅助鉴定待测马铃薯薯形的引物对在鉴定或辅助鉴定待测马铃薯为圆薯形马铃薯还是长薯形马铃薯中的应用;
所述引物对由序列表中序列1所示的DNA分子和序列表中序列2所示的DNA分子组成;
所述圆薯形马铃薯为块茎的最大纵轴的长度与最大横轴的长度的比值I<1.4的马铃薯;所述长薯形马铃薯为块茎的最大纵轴的长度与最大横轴的长度的比值I≥1.4的马铃薯;
所述纵轴为匍匐茎生长方向;
所述横轴为垂直于匍匐茎生长方向。
4.一种鉴定或辅助鉴定待测马铃薯薯形的引物对在选育或辅助选育圆薯形马铃薯和/或长薯形马铃薯中的应用;
所述引物对由序列表中序列1所示的DNA分子和序列表中序列2所示的DNA分子组成;所述圆薯形马铃薯为块茎的最大纵轴的长度与最大横轴的长度的比值I<1.4的马铃薯;所述长薯形马铃薯为块茎的最大纵轴的长度与最大横轴的长度的比值I≥1.4的马铃薯;
所述纵轴为匍匐茎生长方向;
所述横轴为垂直于匍匐茎生长方向。
5.一种鉴定或辅助鉴定待测马铃薯为圆薯形马铃薯还是长薯形马铃薯的方法,包括如下步骤:
(1)利用引物对对待测马铃薯进行PCR扩增,得到PCR扩增产物;
(2)用Afl II内切酶对所述PCR扩增产物进行酶切,得到酶切产物;
(3)检测所述酶切产物的大小;
所述引物对由序列表中序列1所示的DNA分子和序列表中序列2所示的DNA分子组成;
若酶切产物含有大小为700bp和200bp的片段;则待测马铃薯为或候选为圆薯形马铃薯;
若酶切产物仅含有大小为900bp的片段;则待测马铃薯为或候选为长薯形马铃薯;
所述圆薯形马铃薯为块茎的最大纵轴的长度与最大横轴的长度的比值I<1.4的马铃薯;所述长薯形马铃薯为块茎的最大纵轴的长度与最大横轴的长度的比值I≥1.4的马铃薯;
所述纵轴为匍匐茎生长方向;
所述横轴为垂直于匍匐茎生长方向。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:所述PCR扩增的模板为待测马铃薯的基因组DNA。
7.根据权利要求5或6所述的方法,其特征在于:所述PCR扩增的退火温度为60℃。
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