[发明专利]芝麻抗枯萎病基因紧密连锁分子标记SiFWR2145

说明书

技术领域

本发明属于分子遗传育种技术领域，具体涉及一种与芝麻抗枯萎病基因紧密连锁的SNP分子标记SiFWR2145。

背景技术

芝麻（Sesamum indicum L.，2n=26），属胡麻科胡麻属，是我国重要的特色优质油料作物。我国是芝麻四大主产国之一，年种植面积1200万亩左右，总产量约75万吨，在国际油料贸易中具有重要的地位。

芝麻枯萎病是芝麻两大主要真菌病害之一，在世界范围内普遍发生。芝麻枯萎病由尖孢镰刀菌芝麻专化型（Fusarium oxysporum f. sp. sesami）侵染引起，主要在芝麻苗期和成株期发生。该病主要发生在我国东北、华北、西北、黄淮以及江淮部分地区，常年发病率在5%～10%，病情严重时达30%以上，常导致芝麻种子不成熟、籽粒瘦瘪，并在收获前炸落，严重影响了芝麻的产量的提高。

已有研究表明，现有芝麻种质资源库中抗枯萎病的芝麻种质资源比例较低，育种过程中缺乏高抗病的优异种质资源，加之芝麻抗枯萎病特性表现复杂，因而世界范围内芝麻抗病育种进展均较为缓慢。例如，EL-Bramawy（2006，Plant Protection Science）在大田环境下利用15个芝麻杂交组合对芝麻枯萎病的抗性进行分析，发现不同的组合对芝麻枯萎病的抗性表现出较大的差异。

为准确评价芝麻种质资源的抗枯萎病特性，近几年来我国先后建立了室内苗期鉴定和人工大田成株鉴定技术体系，并应用于芝麻抗病遗传育种研究（仇存璞等，芝麻枯萎病病原茵致病力室内鉴定方法，2014，植物病理学报）；相应鉴定技术也申请了专利保护（ZL201110412325.7）。

近年来，利用基因遗传工程进行的分子辅助育种在农作物新品种培育工作表现出了较好地应用效果。针对芝麻的种质资源，2011年以来，我国研究人员开展了较为广泛地芝麻种质资源抗枯萎病基因组扫描工作，结合病圃多年多点鉴定结果，在分析连锁不平衡、群体结构和kinship的基础上，运用全基因组关联方法（GWAS）开发出了抗病基因定位和功能性分子标记数十个，这些分子标记对表型变异表现出了不同的解释率，较好地推动了芝麻抗病育种的研究发展。

但是，由于芝麻枯萎病抗性为数量性状，抗病水平易受气温、降雨等环境影响，抗病分子遗传和分子辅助育种研究进展不够明显。因此，当前仍需进一步探索获得新的芝麻抗枯萎病紧密关联的分子标记，从而为加快芝麻抗病遗传基础和抗病育种研究提供技术支撑。

发明内容

本发明的主要目的是提供一种与芝麻抗枯萎病基因紧密连锁的SNP分子标记SiFWR2145，同时提供了一种利用PCR技术检测该分子标记的检测方法。

本发明所采取的详细技术方案如下。

一种与芝麻抗枯萎病基因紧密连锁的分子标记SiFWR2145，该标记在SNP遗传图谱中的位置为111.5~112.7cM，位于第8连锁群，对抗枯萎病病指的解释率为51.66%（Vg/Vp），该标记包含107bp，其序列如SEQ ID No.1所示，具体为：

AGATGTTTTAAAAAGAGACAGTAAATGCAGCTTTTGCAATTGCTTCTCTTGTGCCTTTTCACATTCTGTTTTTGGGTTTTGCAAGAAGCTCCAATCCCTCCTATTTC。

需要说明的是，上述SNP位点序列中第25个碱基A，当A变为G时，植株抗病性往往发生显著变化，多表现为感病；

换言之，本申请SiFWR2145等位位点序列为：

AGATGTTTTAAAAAGAGACAGTAAGTGCAGCTTTTGCAATTGCTTCTCTTGTGCCTTTTCACATTCTGTTTTTGGGTTTTGCAAGAAGCTCCAATCCCTCCTATTTC。

对于所述分子标记SiFWR2145的检测方法，包括以下步骤：

（1）提取待测芝麻种子资源的基因组DNA；

（2）利用Primer premier 5.0软件设计引物对，引物序列设计如下：

正向引物1 Primer 9-1F序列为：5’ AGATGTTTTAAAAAGAGACAGTAAA 3'；

正向引物2 Primer 9-2F序列为：5' ATACAAGATGTTTTAAAAAGAGACAGTAAG 3'；