[发明专利]胃癌预后新型分子标志物lncRNA-AB007962的检测及用途在审

专利信息
申请号: 201510527739.2 申请日: 2015-08-25
公开(公告)号: CN105018639A 公开(公告)日: 2015-11-04
发明(设计)人: 王振宁;宋永喜;王嘉俊;马斌;杨宇翀;孙景旭;高鹏;陈晓婉 申请(专利权)人: 王振宁
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/113
代理公司: 沈阳智龙专利事务所(普通合伙) 21115 代理人: 周楠;宋铁军
地址: 110001 辽宁省沈阳市和平区*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 胃癌 预后 新型 分子 标志 lncrna ab007962 检测 用途
【说明书】:

技术领域:

发明属于肿瘤分子生物学领域,具体涉及胃癌根治术后预后领域,具体而言,本发明涉及一种胃癌预后新型分子标志物lncRNA-AB007962的用途及其制备的检测试剂盒。

背景技术:

胃癌是全世界范围内最常见的恶性肿瘤之一,在我国,胃癌的发病率及致死率均高居前列,因其早期症状的不典型,造成了明确诊断时,多已到达了进展期。胃癌患者根据不同原则可以分为多种类型,例如:根据组织分化程度分型可以分为高、中、低分化型胃癌,此外,Lauren分型作为临床上经常应用的分类方法,可以将胃癌患者分为肠型、弥漫型和混合型。不同分型患者的生存期存在显著差异,能为患者预后起到一定预示作用。但是,目前对胃癌的预后判断没有明确的参考标准,对不同分型的胃癌也没有特异性的预后指标,远远不能满足对患者个体化的预后评判的需求。因此,明确胃癌患者或不同分型胃癌患者的预后指标,成为胃肠肿瘤外科领域亟待解决的重要课题。

LncRNA是一类转录本长度大于200个核苷酸的非编码RNA,它具有多种生物学功能,在染色质修饰、转录、翻译、剪切、表观遗传学调控等多种生物过程发挥重要作用。研究表明,lncRNA在前列腺癌、肺癌、乳腺癌、结肠癌、肝癌等多种肿瘤组织中呈现异常表达,并在肿瘤发生、发展过程中起促癌或抑癌作用。近年来,lncRNA成为研究热点,并在临床诊断、化疗敏感性和预后评价等方面显示出重要的应用价值,逐渐受到研究者的重视。

发明内容:

发明目的:

本发明提供一种胃癌新型分子标志物长链非编码lncrna-AB007962的检测试剂盒,解决了为Lauren分型为肠型胃癌患者的预后生存期评价的问题。

技术方案:

在胃癌组织中低表达的分子标志物lncRNA-AB007962,其特征在于:lncRNA-AB007962的核酸序列为SEQ ID No.1。

上述分子标志物lncRNA-AB007962的用途,其特征在于:用于制备评估Lauren分型为肠型的胃癌患者预后的试剂盒。

试剂盒采用实时荧光定量PCR检测试剂盒,该试剂盒包括:

(1)癌与癌旁组织提取总RNA试剂;

(2)总RNA反转录为cDNA试剂;

(3)定量PCR检测表达试剂。

该试剂盒包括:

(1)癌与癌旁组织提取总RNA试剂:TRIzoL、三氯甲烷、异丙醇、75%乙醇、无酶水;

(2)总RNA反转录为cDNA试剂:gDNA Eraser、5X gDNA Eraser Buffer、PrimeScript RT Enzyme Mix I、5X PrimerScript Buffer 2、RT Primer Mix、RNase Free dH2O;

(3)定量PCR检测表达试剂:lncRNA-AB007962实时荧光定量PCR特异性引物、GAPDH内参实时荧光定量PCR特异性PCR引物、实时荧光定量SYBR染料、无酶水。

定量PCR检测试剂中包含用于检测lncRNA-AB007962表达的引物序列,引物序列为SEQ ID No.2,以及作为内参的基因GAPDH表达的引物序列,引物序列为SEQ ID No.3。

所用定量PCR检测表达试剂中的引物序列适用于SYBR Green、TaqMan探针、分子信标、双杂交探针、复合探针的检测。

优点及效果:

本发明提出了一种胃癌新型分子标志物长链非编码lncRNA-AB007962及其检测试剂盒,具有如下优点:

本发明提供一种在胃癌组织中低表达的长链非编码RNA-AB007962分子标志物及应用方法,该基因被命名为lncRNA-AB007962,长度为5053个核苷酸,定位于1号染色体149627309-149651107之间,可应用于Lauren分型为肠型的胃癌患者术后早期的预后判断,该lncRNA序列详见SEQ NO:1。对人胃癌与配对癌旁正常组织样本中通过实时荧光定量PCR验证,lncRNA-AB007962在胃癌组织中明显低表达(p<0.05),与胃癌患者的肿瘤最大径显著相关(p=0.033),与Lauren分型为肠型的胃癌患者预后生存时间显著相关(p=0.006),lncRNA-AB007962高表达患者比低表达患者具有更久的生存期。

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