[发明专利]一种与调控温敏半矮生型桃节间长度紧密连锁的SNP标记及其应用

说明书

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，具体涉及一种与调控温敏半矮生型桃节间长度紧密连锁的SNP标记及其应用。

背景技术

桃[Prunus persica(L.)Batsch]为多年生落叶果树，萌芽力强、生长量大。优化树体结构是解决上述问题的关键途径，株高是优化树体结构的重要组成部分，降低树体高度有助于高密栽培、提高单位面积产量、节约劳动力成本、提高桃树种植的经济效益和果园的经济寿命(Bassi et al.,1994；王志强等，2004)。实现树体有限矮化和优化树冠结构有两种途径，一是通过栽培手段(砧木或化学调控等)；二是通过品种的遗传改良。由于迄今未获得具有理想矮化效果的桃砧木，化学调控的安全性又存在争议，因此，培育树体有限矮化、树冠结构合理、经济系数高和易于管理的品种，已成为桃育种的重要目标(Chalmers et al.1981；Bassi et al.1994；王志强等，2004；牛良等，2012)。

半矮生型是重要的生长型之一，其植株高度介于普通生长型和矮化型之间，植株高度为普通生长型的2/3-1/2(Gradziel et al.1993)。目前，半矮生型有3种:不完全显性单基因控制的半矮生型(Monet et al.1975)、单基因显性控制的半矮生型(Gradziel et al.1993)以及我们发现的依赖温度调控节间长度的半矮生型。该性状受一对等位基因控制，对普通型为显性，树体仅为普通型的1/2-1/3，节间较短，果枝粗壮而长度适中，年修剪量极小，是比较理想的有限矮化树型(王志强等，2004)。

近年来随着生物技术的进步，特别是基于二代测序的标记技术加速了作物基因的精细定位和分子辅助选种体系的建立(Takagi et al.2013；Abe et al.2012)。果树进展较快，克隆了许多重要经济性状的基因并建立了分子辅助选种体系，如苹果红肉颜色基因(Chagnéet al.2007)、苹果柱型基因(Petersen and Krost,2013；Otto et al.2014；Bai et al.2012)、桃黄/白肉基因的克隆(Adami等2013)。控制桃树型基因的精细定位和基因克隆进展相对较慢，目前仅克隆了控制桃分枝角度的TAC1基因(Dardick et al.2013)，精细定位控制其它树型基因并获得相关的分子标记是建立不同树型的分子辅助选种体系，并创制新的种质获得理想树型是桃产业中急需解决的关键问题之一。基于此，本发明在获得温度敏感型半矮生型桃新种质的基础上开展了目标性状的精细定位，并得到一个紧密连锁的SNP标记，实现对目标性状进行分子鉴定，确立目标性状的分子辅助选种体系。

发明内容

解决的技术问题：本发明针对以上情况，提供一种与调控温敏半矮生型桃节间长度紧密连锁的SNP标记及其应用。

技术方案：一种与调控温敏半矮生型桃节间长度紧密连锁的SNP标记，所获得的紧密连锁SNP标记为SNP260k-1和SNP260k-13，分别位于桃基因组(Version 1.0)Scaffold 3的2.850Mb和3.003Mb处。

上述SNP标记在调控温敏半矮生型桃节间长度中的应用。

一种鉴定与调控温敏半矮生型桃节间长度的引物对，如下所示：

SNP260k-1的引物对为：5-AGGGTTTCATGGCGTTAAAGC-3；

5-AAACTGAACTGCTCTTCCACGG-3；

SNP260k-13的引物对为：5-CTTTTCTCCGCCGCGTTAAT-3；

5-CCCGGGATGTGACAATTTGG-3。

上述引物对在鉴定与调控温敏半矮生型桃节间长度中的应用。

上述引物对在鉴定如上所述与调控温敏半矮生型桃节间长度紧密连锁的SNP标记中的应用。

含有上述引物对的试剂盒。

有益效果：本发明采用基于SNP的第三代标记标记技术，结合构建的分离杂交群体，采用图位克隆的方法，对调控温敏型半矮生桃节间长度的基因进行了精细定位，在精细定为区域内，开发稳定的、共显性和多态性的SNP标记，以获得与目标性状紧密连锁的标记。由于研究的对象为基于温度调控节间长度的半矮生型桃，可依据获得的紧密连锁标记克隆目标性状的基因，应用于分子辅助选种。

附图说明

图1温度启动半矮生型节间的伸长图；

图2温度对普通生长型节间伸长基本无影响图；

图3普通生长型(左)和半矮生型(右)节间长度比较图；