[发明专利]与辣椒CMV抗性基因紧密连锁的分子标记genSSR3000及获取、应用有效
申请号: | 201510591517.7 | 申请日: | 2015-09-16 |
公开(公告)号: | CN105368927B | 公开(公告)日: | 2018-03-09 |
发明(设计)人: | 张晓芬;耿三省;陈斌;孙宏贺 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京五洲洋和知识产权代理事务所(普通合伙)11387 | 代理人: | 刘春成,王蔚林 |
地址: | 100097 北京市海*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 辣椒 cmv 抗性 基因 紧密 连锁 分子 标记 genssr3000 获取 应用 | ||
1.与辣椒CMV抗性基因紧密连锁的分子标记,其特征在于:用于扩增所述分子标记的引物的核苷酸碱基序列如序列表中的SEQ ID NO:1~2。
2.与辣椒CMV抗性基因紧密连锁的分子标记的应用,其特征在于:所述分子标记应用辣椒材料中cr基因的检测;用于扩增所述分子标记的引物的核苷酸碱基序列如序列表中的SEQ ID NO:1~2。
3.根据权利要求2所述与辣椒CMV抗性基因紧密连锁的分子标记的应用,其特征在于:
所述检测包括以下步骤:
辣椒材料基因组DNA提取步骤:对辣椒材料进行提取处理,得到辣椒材料基因组DNA;
PCR扩增反应步骤:以所述序列表中的SEQ ID NO:1~2作为PCR引物,以所述辣椒材料基因组DNA作为模板,进行PCR扩增反应,得到扩增产物;
分析步骤:将所述扩增产物进行电泳分离处理,显色处理,再统计分析所述辣椒材料是否含有cr基因。
4.根据权利要求3所述与辣椒CMV抗性基因紧密连锁的分子标记的应用,其特征在于:
所述PCR扩增反应步骤中,PCR标记反应体系中含有:
模板DNA 0.5-2.0ng/μL,正向、反向引物各1-10ng/μL,dNTP各100-500μmol/L,MgCl2 1-5mmol/L,Taq DNA聚合酶0.1-0.5U/μL,体积百分比为10-20%的10×Taq Buffer。
5.根据权利要求4所述与辣椒CMV抗性基因紧密连锁的分子标记的应用,其特征在于:
所述PCR标记反应体系中含有:
模板DNA 1.6ng/μL,正向、反向引物各5ng/μL,dNTP各100μmol/L,MgCl2 1mmol/L,Taq DNA聚合酶0.1U/μL,体积百分比为10%的10×Taq Buffer。
6.根据权利要求3所述与辣椒CMV抗性基因紧密连锁的分子标记的应用,其特征在于:
所述PCR扩增反应步骤中,PCR标记反应体系中含有:
体积百分含量为10-50%的模板DNA,所述模板DNA的浓度为2.5ng/μL,正向、反向引物的体积百分含量各5-15%,所述正、反向引物的浓度为50ng/μL,体积百分含量为40-60%的GoMaster mix。
7.根据权利要求6所述与辣椒CMV抗性基因紧密连锁的分子标记的应用,其特征在于:
PCR标记反应体系中含有:
体积百分含量为30%的模板DNA,正向、反向引物的体积百分含量各10%,所述正、反向引物的浓度为50ng/μL,体积百分含量为50%的GoMaster mix。
8.根据权利要求3至7中任一项所述与辣椒CMV抗性基因紧密连锁的分子标记的应用,其特征在于:
所述PCR扩增反应步骤中,PCR反应程序为:94℃预变性4min;94℃变性15s,55℃退火15s,72℃延伸30s,34个循环;72℃保温5min。
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