[发明专利]一种影响猪肌肉C20:0饱和脂肪酸含量的关键标记位点及其应用

说明书

本发明涉及一种影响猪肉脂肪酸组分的SNP标记，其特征在于，所述SNP标记位于猪16号染色体上的超长链脂肪酸延伸酶7基因的核苷酸序列上，所述SNP标记为SEQ ID NO:1上的第8462位的位点上由G到A的突变，或者为SEQ ID NO:1上的第11062位的位点上由C到T的突变。本发明还涉及用于鉴定该SNP标记的探针及其应用。本发明进一步涉及一种猪育种的方法，以及一种用于所述猪育种的检测方法。

关联申请的交叉引用

本申请要求于2015年8月26日提交的申请号为201510531321.9的中国专利申请(该申请的发明名称为“一种SNP标记及其应用”)的优先权。该申请的全部内容通过引用结合于本文中。

技术领域

本发明涉及一种生物标记，尤其涉及一种SNP标记。本发明还涉及用于鉴定该SNP标记的探针及其应用。本发明进一步涉及一种猪育种的方法，以及一种用于所述猪育种的检测方法。

背景技术

脂肪酸(FA)是细胞的基本组成部分，在机体内对存储能量，信息传递及代谢调控等方面起着重要的作用。但是高含量的饱和脂肪酸对机体健康十分不利。比如花生酸(arachidic acid)，这是一种含有20个碳的饱和脂肪酸，主要以三酰甘油的形式存在。它会降低猪肉品质，促使食用该猪肉的人体血液中低密度脂蛋白和总胆固醇含量的升高，引发心脑血管疾病，对人体健康极为不利；而不饱和脂肪酸则有助于降低人体血液中低密度脂蛋白和总胆固醇含量、提高免疫力和降低癌症风险。同时，花生酸会引起细胞内炎症因子的表达，从而诱发较多疾病，如发热反应、败血症等。因此，本领域亟需优化猪肉中脂肪酸组成，从而提高猪肉营养水平，从而能够生产出更高品质的猪肉。

检测花生酸含量对猪很多疾病有非常重要的意义，但是目前并没有相关仪器进行活体测量。另外将生猪进行屠宰测定，成本昂贵，且不能实现个体的直接选择，这使得基于家系和表型测定的传统育种效率低下。通过搜寻发生酸的主效基因及其关键变异位点，并利用这些位点作为分子标记选择花酸含量较低的优异猪种来生产，不需要详细的系谱记录和后代表型信息，且可实现早期选种，能极大提高种猪肉质遗传改良的效率。

目前花生酸的主效基因的置信区间较大，如2009年，Guo等利用194个微卫星标记，采用连锁分析模型，将花生酸的主效基因的置信区间定位到40-50cM之间，长达10.5cM。2013年，Yang等利用苏太群体中将此区间缩小到4.84Mb(38.71–43.53Mb)。但是在此区间仍然无法确定真正的主效基因及其关键变异位点，仍然难以直接应用于种猪选育改良。因此，本领域亟需一种能够有效地影响猪肉脂肪酸组分的SNP标记。

发明内容

为了解决上述现有技术中存在的问题，本发明提供了一种新的影响猪肉脂肪酸组分的SNP标记。

本发明的一个目的在于，提供一种影响猪肉脂肪酸组分的SNP标记，所述SNP标记位于猪16号染色体上的超长链脂肪酸延长延伸酶7基因(ELOVL7基因)的核苷酸序列上，所述SNP标记为SEQ ID NO:1上的第8462位的位点上由G到A的突变，或者为SEQ ID NO:1上的第11062位的位点上由C到T的突变。

本发明通过现代分子生物学技术检测这两个关键标记位点的基因型，判定携带降低饱和脂肪酸含量有利等位基因的个体。

在本发明的一个优选的实施方式中，所述SNP标记为主效SNP标记。

在本发明的一个优选的实施方式中，所述SNP标记的位点为国际猪基因组10.2版本参考序列猪16号染色体上g.42561841核苷酸位点为G与A的突变，对应于SEQ ID NO:1上的第8462位，或所述SNP标记的位点为国际猪基因组10.2版本参考序列猪16号染色体上g.42564441核苷酸位点为C与T的突变，对应于SEQ ID NO:1上的第11062位。