[发明专利]辅助大肠癌的再发风险诊断的计算机系统、程序及方法

说明书

由本发明提供大肠癌的再发风险的判断中使用的计算机系统。此计算机系统具备含处理器和存储器的计算机。在此存储器中记录有使在上述计算机中实行的计算机程序，接收从自大肠癌患者采集的活体样品中的第18染色体长链上的18q21～18q23的区域中存在的第1基因组选择的多个基因的表达量，接收从自大肠癌患者采集的活体样品中的第20染色体长链上的20q11～20q13的区域中存在的第2基因组选择的多个基因的表达量，以及接收从自大肠癌患者采集的活体样品中的含ANGPTL2、AXL、C1R、C1S、CALHM2、CTSK、DCN、EMP3、GREM1、ITGAV、KLHL5、MMP2、RAB34、SELM、SRGAP2P1及VIM的第3基因组选择的多个基因的表达量的工序，及基于接收的表达量，判断上述患者的大肠癌的再发风险的工序。

【技术领域】

本发明涉及辅助诊断大肠癌的再发风险的方法。特别涉及对于从大肠癌患者的组织得到的核酸，取得属于指定基因组的基因的表达量数据，基于取得的表达量数据，辅助该患者的大肠癌的再发风险的诊断的方法、程序及计算机系统。

【背景技术】

大肠癌是在盲肠、结肠、直肠中发生的癌症肿瘤的总称。与多种癌同样地，在大肠癌中，早期的发现对于其治疗也是重要的。在癌的治疗中，有时使用有很强的副作用的抗癌剂，在此时患者被加以大的负担。为了降低这样的患者的负担，医师根据患者选择最适的治疗法是重要的，为此，医师有必要确切掌握患者的癌的进展程度、恶性度、症状等。

另外，正确地预测患者的预后对于患者的预后中的QOL(生活质量)的提高是重要的。作为用于进行大肠癌的预后预测的方法，已知有作为组织病理学方法的Dukes分类。Dukes分类在国际上广泛使用，根据癌的浸润的程度分类为Dukes A、B、C及D的任何一种的方法。Dukes分类由于是医师用肉眼进行的分类法，有易发生因医师造成的误差的问题。另外，也有容易由取得大肠癌组织的设施的差异发生诊断差异的问题。

近年，在开展对于关注特定的基因的表达量的增减的，使用基因标志物的癌的预后预测的研究。例如，在US专利公开2008/058432中公开了，诊断为大肠癌的，或者接受大肠癌的治疗的患者中的用于预测大肠癌的再发的分子的解析。US专利公开2008/058432中公开的技术是进行对特定的大肠癌的再发的预后预测的技术，存在无法适用于全部大肠癌的问题。

【发明内容】

【发明要解决的技术课题】

本发明旨在对于各种的病例的大肠癌，提供信赖性高的大肠癌的再发风险的诊断辅助方法、程序及计算机系统。

【解决课题的技术方案】

本发明人为解决上述的课题，重复锐意研究的结果发现，由聚类分析，可将大肠癌分为3种类型。并且发现，此3个类型与大肠癌的预后关联，且得到的结果充分地稳定，由此完成本发明。

由本发明提供大肠癌的再发风险的判断中使用的计算机系统。

此计算机系统具备含处理器和存储器的计算机。

在此存储器中记录有使在上述计算机中实行的计算机程序，

接收从自大肠癌患者采集的活体样品中的第18染色体长链上的18q21～18q23的区域中存在的第1基因组选择的多个基因的表达量，接收自第20染色体长链上的20q11～20q13的区域中存在的第2基因组选择的多个基因的表达量，以及，接收自含ANGPTL2、AXL、C1R、C1S、CALHM2、CTSK、DCN、EMP3、GREM1、ITGAV、KLHL5、MMP2、RAB34、SELM、SRGAP2P1及VIM的第3基因组选择的多个基因的表达量的工序，及

基于接收的表达量，判断上述患者的大肠癌的再发风险的工序。

【发明效果】

由本发明可提供信赖性高的大肠癌再发风险的诊断辅助方法。