[发明专利]一种重组基因工程菌构建及高活性β-D-1;4-内切木聚糖酶的制备与应用有效
申请号: | 201510629965.1 | 申请日: | 2015-09-24 |
公开(公告)号: | CN105219664B | 公开(公告)日: | 2019-07-05 |
发明(设计)人: | 张慧玲;汪艳;杨玉霞;胡玮 | 申请(专利权)人: | 新疆农业大学;张慧玲 |
主分类号: | C12N1/19 | 分类号: | C12N1/19;C12N9/42;C12N15/81;C12N15/66;C12P19/14;C12R1/84 |
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地址: | 830052 新疆维吾尔*** | 国省代码: | 新疆;65 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 重组 基因工程 构建 活性 内切木 聚糖 制备 应用 | ||
1.一种基因工程菌巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)GS115/pPIC9K-xynAm ,其特征在于,巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)GS115/pPIC9K-xynAm 菌种保藏编号为CGMCCNo.10696。
2.如权利要求1 所述基因工程菌巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)GS115/pPIC9K-xynAm的β-D-1,4-内切木聚糖酶基因序列,其特征在于,所述序列如SEQ ID NO.1所示。
3.如权利要求1所述基因工程菌巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)GS115/pPIC9K-xynAm的β-D-1,4-内切木聚糖酶氨基酸序列,其特征在于,所述序列如SEQ ID No.4 所示。
4.如权利要求1 所述一种基因工程菌巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)GS115/pPIC9K-xynAm在制备β-D-1,4-内切木聚糖酶中的应用。
5.一种如权利要求2所述的β-D-1,4-内切木聚糖酶基因序列优化方法,其特征在于,所述的具体优化方法步骤如下:
(1)在GenBank中检索出厌氧真菌Orpinomyces sp. PC-2 β-D-1,4-内切木聚糖酶基因序列,登录号:U57819;
(2)删除步骤(1)的β-D-1,4-内切木聚糖酶基因的N端编码MRTIKFLFALAITTVAKA的密码子;
(3)根据酵母密码子偏爱性对β-D-1,4-内切木聚糖酶基因的密码子进行初步替换;
(4)采用Oligo 6.0分析步骤(3)替换后基因序列中的限制性内切酶切割位点,通过密码子调整,消除基因序列中的Bgl II、Sac I、Sal I、SnaB I和Avr II的切割位点;
(5)采用BioEdit 7.0 分析步骤(4)调整后基因序列中mRNA 隐蔽剪接位点,并再次对密码子进行调整,以消除其中的隐蔽剪接位点GGTAAG、GGTGAT、AATAAA、ATTTA、AAAAAA和TTTTTT以及mRNA不稳定基序,并计算GC百分比,根据GC百分比对密码子进一步调整,使其处于40%-50%之间;
(6)采用RNA Structure 3.2 对步骤(5)的mRNA 二级结构的自由能进行分析,筛选获得自由能最低的基因序列,命名为xynAm;
(7)通过对步骤(6)筛选获得的xynAm基因序列采用全基因合成方法获得SEQ ID No. 1所示核苷酸序列。
6.根据权利要求2所述优化的β-D-1,4-内切木聚糖酶基因xynAm的重组载体,其特征在于,所述重组载体为pPIC9K-xynAm,所述重组载体pPIC9K-xynAm的具体构建方法为:将权利要求5提供的xynAm基因和毕赤酵母表达载体pPIC9K均用SnaB I和Avr II双酶切,回收纯化酶切产物,纯化的目的基因和表达载体采用T4 DNA连接酶进行连接,转化大肠杆菌DH5α,经PCR以及BamH I 和 Sal I双酶切鉴定获得重组表达载体pPIC9K-xynAm。
7.一种如权利要求1所述基因工程菌巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)GS115/pPIC9K-xynAm制备的高活性β-D-1,4-内切木聚糖酶。
8.如权利要求7所述高活性β-D-1,4-内切木聚糖酶在用于非治疗目降解木聚糖中的应用。
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