[发明专利]一种鞘脂菌(Sphingobium sp.)IBY及其在吸附降解疏水性有机物中的应用

说明书

本发明公开了一种鞘脂菌(Sphingobium sp.)IBY及其在吸附降解疏水性有机物中的应用。该菌于2015年7月1日保存于中国典型培养物保藏中心(CCTCC)，地址：中国武汉市武汉大学，保藏编号为CCTCC NO：M 2015419。本发明提供了一种具有降解疏水性有机物能力的疏水细菌新种：鞘脂菌(Sphingobium sp.)IBY，为疏水性有机物的环境污染治理提供了有效的降解菌种资源。

技术领域

本发明属于微生物技术领域，具体涉及一种鞘脂菌(Sphingobium sp.)IBY及其在吸附降解疏水性有机物中的应用。

背景技术

细菌细胞的疏水相互作用是指疏水性较强的细胞能够避开水而易与疏水性较强的物质发生作用。疏水性是决定细菌非特异性黏附到各种生物和非生物表面及界面的最重要因素之一，也是影响细菌吸收和降解疏水性有机物的主要因素之一。在利用微生物降解疏水性有机物的过程中，细胞表面疏水性影响细菌对污染物的黏附，能促进细菌对疏水性有机物的吸附和降解。

结构决定性质，细菌细胞表面疏水性是菌体的表面性质之一，也必定是菌体表面结构所决定的。研究表明，革兰氏阴性菌的脂多糖和外膜蛋白与菌体表面疏水性具有一定的关联。鞘脂菌(Sphingobium)属细菌属于广义上的鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas)，其细胞膜组成不同于一般的革兰氏阴性菌特有的脂多糖，而取而代之的是鞘糖脂，因此推测广义鞘氨醇单胞菌比其他革兰氏阴性菌具有更强的细胞表面疏水性。

虽然广义鞘氨醇单胞菌被认为比其他革兰氏阴性菌具有更强的细胞表面疏水性，但目前所报道的广义鞘氨醇单胞菌都是亲水菌，它们细胞表面疏水性都不高，仍不属于疏水细菌，而且细胞表面疏水性随着细菌生长状态的不同而表现差异，并与培养过程添加的碳源物质和电子受体有关。一种性质稳定的真正意义上的疏水细菌的获得，无疑将给疏水性有机物的污染问题的解决带来曙光。

发明内容

本发明的第一个目的是提供一种疏水鞘脂菌(Sphingobium sp.)IBY，该细菌于2015年7月1日保存于中国典型培养物保藏中心(CCTCC)，地址：中国武汉市武汉大学，保藏编号为CCTCC NO：M 2015419。

本发明的鞘脂菌(Sphingobium sp.)IBY是通过对广东汕头某电子垃圾集中处理区的河床底泥进行富集培养、分离、纯化，得到Sphingobium属的一个新种。

鞘脂菌(Sphingobium sp.)IBY的形态学和生理生化特征：该菌24h平板培养物菌落圆形、黄色，突出培养基，透明，直径0.5-1.0mm。菌体革兰氏阴性，不形成芽孢，端生鞭毛。菌体呈现长1.0-3.0μm宽0.6-0.9μm的长杆状形态。氧化酶和过氧化氢酶阳性。该菌能在好氧和兼性厌氧条件下生长，生长pH 4.0～9.0。

鞘脂菌(Sphingobium sp.)IBY的分子分类学地位：按照常规方法提取鞘脂菌(Sphingobium sp.)IBY的总DNA。采用16S rRNA通用引物8F和1492R利用高保真酶扩增其16S rRNA基因，将PCR产物连接T载体后挑选阳性克隆进行测序，获得其16S rRNA基因序列，其序列如SEQ ID NO.1所示。将该序列与NCBI的GenBank中序列进行比对，进行BLAST分析，结果发现鞘脂菌(Sphingobium sp.)IBY的16S rRNA基因序列与Sphingobium属的已有模式菌株具有较高的相似性，其中与Sphingobium xenophagum BN6的序列相似性为99％。再扩增其gyrB基因，将PCR产物连接T载体后挑选阳性克隆进行测序，获得的gyrB基因序列，其序列如SEQ ID NO.2所示。经BLAST分析，其与Sphingobium xenophagum BN6相似度为96％。采用复性速率液相杂交法测得鞘脂菌(Sphingobium sp.)IBY与Sphingobium xenophagumBN6的全基因组DNA-DNA杂交率为54.5％。