[发明专利]中国儿童哮喘易感基因SNP分型用试剂盒及其使用方法在审
申请号: | 201510671259.3 | 申请日: | 2015-10-16 |
公开(公告)号: | CN105238861A | 公开(公告)日: | 2016-01-13 |
发明(设计)人: | 严提珍;龙易勤;曾定元;唐宁;王麟;郑敏;李伍高;李哲涛;余宾;罗世强;廖燕玲 | 申请(专利权)人: | 柳州市妇幼保健院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 柳州市荣久专利商标事务所(普通合伙) 45113 | 代理人: | 韦微 |
地址: | 545001 广*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 中国 儿童哮喘 基因 snp 分型用 试剂盒 及其 使用方法 | ||
1.一种中国儿童哮喘易感基因SNP分型用试剂盒,其特征在于:该试剂盒包括以下内容:
(1)PCR反应试剂:包括10×PCR缓冲液、Mg2+离子、底物dNTP、FastTaq酶,SNaPshot混合液,GCbuffer;
(2)按一定比例混合的针对8个哮喘易感基因9个区段进行多重PCR扩增的正向引物和反向引物;
(3)按一定比例混合的针对8个哮喘易感基因9个SNP位点的PCR延伸引物;
(4)PCR产物纯化试剂:包括核酸外切酶、虾-碱性磷酸酶及其配套的缓冲液;
(5)对照标本:包括单个SNP位点纯合、杂合突变的阳性对照标本、阴性对照标本;
所述试剂盒以ADRB2基因rs1042713位点、IL-4Rα基因rs1805010位点、IL-13基因rs20541位点、IL-13基因rs1800925位点、IL-13Rα基因rs2495636位点、IL-4基因rs2243250位点、TNF-α基因rs1800629位点、MS4A2基因rs569108位点、ADAM33基因rs528557位点为检测对象,针对每个SNP位点的突变分别设计出扩增引物和延伸引物,针对各个SNP位点进行多重PCR扩增和标记延伸,通过毛细管电泳分析,同时获得9个SNP位点的基因型;
所述ADRB2基因rs1042713位点扩增的正向引物和反向引物是5’-ACACCACAGCCGCTGAATG-3’和5’-TGGCCAGGACGATGAGAGAC-3’;
所述IL-4Rα基因rs1805010位点扩增的正向引物和反向引物是5’-AAGAGTCTGATGCGGTTCCTG-3’和5’-TTGAAGGAGCCCTTCCACAG-3’;
所述IL-13基因rs20541位点扩增的正向引物和反向引物是5’-AATCTGCAACTTCAATAGTC-3’和5’-GTAAAGGACCTGCTCTTAC-3’;
所述IL-13基因rs1800925位点扩增的正向引物和反向引物是5’-ATCAACACCCAACAGGCAAAT-3’和5’-CCAGCGTCTCCAGGACTTATT-3’;
所述IL-13基因rs1800925位点扩增的正向引物和反向引物是5’-ATCAACACCCAACAGGCAAAT-3’和5’-CACCAGTCTCTGCAGGATCAAC-3’;
所述IL-4基因rs2243250位点扩增的正向引物和反向引物是5’-TGCAGTGATCCCTGATCACAAC-3’和5’-AGAGGCAGAATAACAGGCAGACT-3’;
所述TNF-α基因rs1800629位点扩增的正向引物和反向引物是5’-CACAGGCCTCAGGACTCAACA-3’和5’-TCTTCTGGGCCACTGACTGAT-3’;
所述MS4A2基因rs569108位点扩增的正向引物和反向引物是5’-CAAGACCTTGGCCTTCTGGA-3’和5’-AGCGTGAGACCCAGAAAGACA-3’;
所述ADAM33基因rs528557位点扩增的正向引物和反向引物是5’-AACCGCAGGAGTAGGCTCAG-3’和5’-CCGCAGACCATGACACCTTC-3’;
所述ADRB2基因rs1042713位点位点的延伸引物是(T)21CGGCGCATGGCTTC;
所述IL-4Rα基因rs1805010位点的延伸引物是(T)23GCAGAGCCCACACGTGT;
所述IL-13基因rs20541位点的延伸引物是(T)28CGAAGTTTCAGKTGAAC;
所述IL-13基因rs1800925位点的延伸引物是(T)33GAGGACTTCTAGGAAAA;
所述IL-13Rα基因rs2495636位点的延伸引物序列是(T)36GTTATCTGGGAACTTATTA;
所述IL-4基因rs2243250位点的延伸引物是(T)24TACCCCAGCACTGGGG;
所述TNF-α基因rs1800629位点的延伸引物是(T)26ATAGGTTTTGAGGGGCATG;
所述MS4A2基因rs569108位点的延伸引物是(T)33GTTGGAAGACCCAGGGG;
所述ADAM33基因rs528557位点的延伸引物是(T)40GCCTCTGCTCCCAGG。
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