[发明专利]检测多种新生儿遗传代谢病致病基因的引物及试剂盒有效
申请号: | 201510673660.0 | 申请日: | 2015-10-16 |
公开(公告)号: | CN105177160B | 公开(公告)日: | 2018-10-16 |
发明(设计)人: | 谭海芹;余文菁;洪旭涛;宓娅娜 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 金祺 |
地址: | 310058 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 多种 新生儿 遗传 谢病 致病 基因 引物 试剂盒 | ||
1.用于新生儿遗传代谢疾病基因体外定性检测的引物的设计方式,其特征是包括如下步骤:
1)、获得遗传病相关的致病基因信息:
通过OMIM数据库获得多种遗传性疾病相关的致病基因信息,包括基因位置信息、突变位点信息,然后根据得到的基因信息从NCBI数据库得到相关基因的外显子及内含子信息;
2)、针对相关基因设计引物:
对于每个基因的外显子及外显子内含子结合区域设计对应的特异性引物F1和R1,设计原则为:每个外显子外延5bp,以保证将外显子内含子结合区域包含在内;引物序列区保守,即不存在突变或SNP,Tm值均一,Tm值的差异在5℃之内;扩增产物至少有10bp的重叠区;在每对引物前加上一段自行设计的序列A1和A2以及一段6个碱基的识别序列,用以二代测序结果的识别;
A1和A2的序列如下:
A1(5’-3’):TCTTTCCCTACCGACGCTCTTCCGATCT
A2(5’-3’):GTGACTGGAGTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT
识别序列有12个,分别为ATCACG,TTAGGC,ACAGTG,TGACCA,GCCAAT,CAGATC,ACTTGA,ATCACG,TAGCTT,GGCTAC,CTTGTA,GATCAG,每段识别序列可随机加到F1和R1中,F1和R1中识别序列的组合方式可以作为测序结果中样品和基因的识别信号;
所得的用于新生儿遗传代谢疾病基因体外定性检测的引物,如表1~表3中的至少1个表格所述;
综合征型耳聋的第一轮PCR引物序列表如下表1;G6PD基因的第一轮PCR引物序列表如下表2;SLC12A3基因第一轮PCR引物序列表如下表3;
表1
表2
表3
2.试剂盒,其特征是:该试剂盒含有如权利要求1所述的引物,该试剂盒能同时检测多种新生儿遗传病。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征是:
可以用于检测葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症、遗传性非综合征耳聋、Gitelman综合征这3种常见新生儿遗传病相关的基因。
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