[发明专利]一种用于检测斑块状角膜营养不良病的SNP位点

说明书

本发明的目的是提供种用于检测斑块状角膜营养不良病的SNP位点，为CHST6基因编码区域由起始密码子起第250‑272位碱基。本发明提供了CHST6基因的新的用途，从而提供了一种有效的进行斑块状角膜营养不良疾病基因诊断、产前基因筛查及遗传咨询的途径，应用效果表明本发明所提供的基因的SNP位点及检测引物可以有效的用于临床患者及胎儿绒毛或羊水进行CHST6基因突变位点的快速检测。

技术领域

本发明属于基因诊断制品技术领域，具体涉及一种用于检测斑块状角膜营养不良病的SNP位点。

发明背景

斑状角膜营养不良(macular corneal dystrophy,MCD)是一种常染色体隐性遗传病，以双侧角膜基质进行性雾状混浊及中央角膜变薄为特征，在临床上较为少见，但发病较严重，早期即明显影响视力。患者通常在10岁以前就双眼较对称发病，视力下降，约在20岁时病情已比较明显，有畏光、流泪及视力下降的症状，角膜病变初期表现为角膜中央浅基质层的细小云雾状浑浊，有的为半透明环状。以后这些细小浑浊逐渐融合为多形、不规则的灰白样，随病情进展向角膜周边延伸和角膜深基质层发展。当角膜混浊的区域向表面扩展形成凸出角膜表面呈结节状，造成角膜不规则散光，而当混浊区域向弹力层发展时，裂隙灯下可见角膜后有大量的内皮赘疣。与其他的角膜营养不良不同，斑块状角膜营养不良在病程发展至晚期，均可出现角膜变薄。

当视力下降明显、影响工作与生活时，可行板层或穿透性角膜移植术进行治疗，但术后都存在复发的可能。根据ELISA法检查病人血清中硫酸角质素(keratan sulfate,KS)抗原浓度的高低及对角膜组织的免疫组化检查，将斑状角膜营养不良分为三型，I型患者的血清和角膜中没有KS的免疫反应，ⅠA型患者的血清中没有KS的免疫反应，但角膜中存在KS的免疫反应，而II患者血清和角膜中都存在KS的免疫反应。

斑块状角膜营养不良发病较早，病情逐渐进展，常双眼发病，对视力影响严重，常合并角膜上皮糜烂而有刺激症状，除了角膜移植手术，目前尚无更好的治疗方法，而手术供体匮乏，术后并发症多并且容易复发，加之手术费用昂贵，给患者家庭和社会带来沉重的经济和精神负担。建立斑块状角膜营养不良的相关的基因突变检测系统，并应用于临床工作和优生优育，有助于遗传性斑块状角膜营养不良的基因诊断和相应的基因治疗，有助于突变基因携带者的检出，有助于通过产前检查降低疾病的发生率，有助于有效地控制这种疾病的发生。

发明内容

本发明的目的是提供一种用于检测斑块状角膜营养不良病的SNP位点，从而弥补现有技术的不足。

申请人从一个5代呈常染色体隐性遗传的斑块状角膜营养不良家系中，对该家系全部成员进行了CHST6基因的测序，找到了该家系的致病基因CHST6存在遗传上的致病突变，从而促成了本发明。

本发明提供一种与斑块状角膜营养不良疾病相关的SNP位点，为CHST6基因编码区域由起始密码子起第250-272位碱基。

其中用于检测上述SNP位点的引物信息如下：

本发明提供了CHST6基因的新的用途，从而提供了一种有效的进行斑块状角膜营养不良疾病基因诊断、产前基因筛查及遗传咨询的途径，应用效果表明本发明所提供的基因的SNP位点及检测引物可以有效的用于临床患者及胎儿绒毛或羊水进行CHST6基因突变位点的快速检测。

附图说明

图1：实施例1的斑块状角膜营养不良家系内患者CHST6测序图，其中A：参考序列；B：患者。该家系中三名患者CHST6基因编码区域由起始密码子起第463-464位碱基发生了纯合突变，其碱基CG发生缺失。