[发明专利]小麦粒重主效QTLQTgw-4A.1的紧密连锁标记及其应用在审
申请号: | 201510690615.6 | 申请日: | 2015-10-22 |
公开(公告)号: | CN105200143A | 公开(公告)日: | 2015-12-30 |
发明(设计)人: | 彭惠茹;关攀锋;贾立加;逯腊虎;张金波;赵月;倪中福;尤明山;解超杰;姚颖垠;辛明明;胡兆荣;孙其信 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;白艳 |
地址: | 100094 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 小麦 粒重 qtlqtgw 紧密 连锁 标记 及其 应用 | ||
技术领域
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种小麦粒重主效QTLQTgw-4A.1的紧密连锁标记及其应用。
背景技术
小麦是我国第二大口粮作物,我国新的粮食安全战略目标是确保水稻、小麦、玉米三大主粮自给率保持在95%以上,其中水稻、小麦两大口粮保持100%自给。因此,进一步提高我国小麦单产对保障国家粮食安全具有重要的现实意义。
在产量的构成因素中,千粒重的直接贡献最大且它的增加是相对独立的,主要受加性效应的控制,其广义遗传力高达59%-80%(庄巧生,2003),比较适合进行遗传学分析和研究,也是目前的研究热点。
Campbell等(1999)利用软麦和硬麦杂交构建的重组自交系群体,在4个环境下检测到5个控制千粒重的QTL,分别位于1A、1B、3B、3DL和7A染色体上,每个QTL所解释的表型变异为5.8%-12.2%。Groos等(2003)研究了以Rena和Récital为亲本构建的重组自交系群体,在6个环境下共检测到9个控制粒重的QTL,其中位于2B、5B和7A染色体上的3个QTL在6个环境中稳定存在且2B染色体上的QTL效应最大,可解释20%的表型变异。张坤普等(2009)以小麦品种花培3号和豫麦57杂交获得的DH群体,将控制千粒重的3个加性QTL定位于3B、4B和6A染色体上,解释的表型变异分别为3.36%、4.39%和14.64%;其中,位于6A染色体上的QTgw-6Ab对千粒重的遗传贡献率最大且在3个环境中稳定表达,可用于分子标记辅助选择育种。Maria等(2014)利用构建的小麦高密度SNP遗传连锁图谱,在3B、4B染色体上也检测到控制千粒重的QTL。近年来,随着小麦基因组数据平台和高通量分子标记技术的快速发展(Jiaetal.2013;Lingetal.2013;Luoetal.2013;Wangetal.2014),小麦产量及相关性状QTL/基因的精细定位和克隆成为可能,从而有利于在产量方面实现小麦分子标记辅助选择育种(MAS)和多个粒重基因的聚合。
前期研究中,贾立加(2013)以农大3338和京冬6号及其衍生的DH群体为基本材料,通过复合区间作图方法对小麦千粒重性状进行的两年三点(分别于2007-2008年度和2008-2009年度在北京、山西临汾和河北石家庄进行种植)实验做了QTL分析,发现4A染色体的两个SNP标记IAAV8683-Excalibur_s107592_195区间内存在一个环境稳定的粒重QTLQTgw-4A.1,其LOD值为3.91-14.91,加性遗传效应为0.86g-2.14g,在六个环境中所解释的表型变异范围为3.13%-10.53%。
发明内容
本发明的一个目的是提供用于鉴定小麦千粒重的引物。
本发明提供的引物,为如下1)或2):
1)由序列表中序列1所示的引物1和序列表中序列2所示的引物2组成;
2)将1)所示引物对中的一个或几个剪辑进行缺失、增加或替换得到具有相同功能的引物对。
本发明另一个目的是提供用于鉴定小麦千粒重的试剂。
本发明提供的试剂,包括上述的引物。
上述试剂中,所述引物中的各条引物的浓度均为10umol/L。
本发明第三个目的是提供用于鉴定小麦千粒重的试剂盒。
本发明提供的试剂盒,包括上述的引物或上述的试剂。
上述的引物或上述的试剂或上述的试剂盒在鉴定待测小麦是否为高千粒重小麦中的应用也是本发明保护的范围;
或上述的引物或上述的试剂或上述的试剂盒在鉴定待测小麦是否为高耐热性小麦中的应用也是本发明保护的范围;
或上述的引物或上述的试剂或上述的试剂盒在鉴定小麦千粒重性状中的应用也是本发明保护的范围;
或上述的引物或上述的试剂或上述的试剂盒在鉴定小麦耐热性性状中的应用也是本发明保护的范围;
上述的引物或上述的试剂或上述的试剂盒在鉴定小麦是否为高千粒重小麦中的应用也是本发明保护的范围;
或上述的引物或上述的试剂或上述的试剂盒在筛选高千粒重小麦中的应用也是本发明保护的范围;
或上述的引物或上述的试剂或上述的试剂盒在筛选耐热小麦中的应用也是本发明保护的范围。
本发明第四个目的是提供一种鉴定小麦千粒重的方法。
本发明提供的方法,包括如下步骤:
1)用上述的引物或上述的试剂扩增待测小麦,得到SSR扩增产物;
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