[发明专利]基于主成分分析与Fish判别法快速鉴别临床致病菌的方法在审
| 申请号： | 201510715830.7 | 申请日： | 2015-10-29 |
| 公开（公告）号： | CN105424645A | 公开（公告）日： | 2016-03-23 |
| 发明（设计）人： | 王武;王建明;李详辉;陈敏;林东红 | 申请（专利权）人： | 福州大学 |
| 主分类号： | G01N21/359 | 分类号： | G01N21/359 |
| 代理公司： | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人： | 蔡学俊 |
| 地址： | 350108 福建省福州市*** | 国省代码： | 福建;35 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 基于 成分 分析 fish 判别 快速 鉴别 临床 致病菌 方法 | ||
1.一种基于主成分分析与Fish判别法快速鉴别临床致病菌的方法，其特征在于：包括以下步骤:
步骤S1：培养临床致病菌样本；
步骤S2：将样本进行近红外光谱扫描，采集这三种细菌的近红外光谱，并剔除异常的样本数据；
步骤S3：选取4003.497~12396.18cm-1特征波段下的光谱信息，运用多元散射校正MSC进行对光谱信息进行处理；
步骤S4：将处理后的光谱数据利用主成分分析法PCA法进行数据的降维处理，在满足累计可信度为>98%条件下选取主成分个数；
步骤S5：经过主成分分析方法后选取相应的主成分后，建立起Fisher判别函数，建立对应的三种细菌的鉴别模型，得到判别函数；
步骤S6：经过Fisher判别分析后，通过特征值和其方差的贡献率来选取出需要的判别函数的个数；
步骤S7：各个种类的细菌在经过主成分分析后的数据，在选取出来的判别函数中，得到在各个判别函数降维后的每种种类的中心值；
步骤S8：通过判别未知的菌类距离每种菌类的中心值来鉴别其类别。
2.根据权利要求1所述的基于主成分分析与Fish判别法快速鉴别临床致病菌的方法，其特征在于：步骤S5建立Fisher判别函数包括以下具体步骤：
步骤S51：求解Fisher判别分析：总体有C类，类内样本点协方差矩阵：，每类距离总体中心协方差矩阵：；其中是各类的中心，是总体中心，是各类的样本数，；
步骤S52：根据度量，得到投影的W取决于求解的特征值对应的特征向量。
3.根据权利要求1所述的基于主成分分析与Fish判别法快速鉴别临床致病菌的方法，其特征在于：所述临床致病菌为金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、大肠埃希氏菌。
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