[发明专利]一种快速检测土壤中病残体携带TMV方法在审
申请号: | 201510737364.2 | 申请日: | 2015-11-03 |
公开(公告)号: | CN105296626A | 公开(公告)日: | 2016-02-03 |
发明(设计)人: | 刘世超;孙现超;许博文;彭浩然;朱虹;青玲 | 申请(专利权)人: | 西南大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 汤东凤 |
地址: | 400715*** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 检测 土壤 病残 携带 tmv 方法 | ||
1.一种快速检测土壤中病残体携带TMV方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取土壤中病残体TMV总RNA;
(2)以提取的总RNA为模板,逆转录得到cDNA;
(3)以cDNA为模板,用以下两对引物进行LAMP扩增,得到扩增产物;第1对引物:
TMV-FIP5'-GCTGTGACTAACGGATCTAATACCG-AGGTTCCCTGACAGTGAC-3'
TMV-BIP5'-GAAGTTGAAAATCAGGCGAACCC-TGCGTCGTCTACTCTACG-3'第2对引物:
TMV-F3:5'-GGAAACCTTCACCACAAGT-3'
TMV-B3:5'-TATAGCGCTCCTTATGGC-3'
(4)用TAE电泳缓冲液配制2%琼脂糖凝胶,取5μLLAMP扩增产物在水平电泳槽中进行电泳,110V/100mA电泳35min,得到目标TMV的瀑布离散型条带。
2.根据权利要求1所述的快速检测土壤中病残体携带TMV方法,其特征在于:步骤A中所述的试剂盒使用,称取0.2g土壤样品代替说明书中的0.5g土壤样品。
3.根据权利要求1所述的快速检测土壤中病残体携带TMV方法,其特征在于:步骤(2)中所述的逆转录过程,根据TMV外壳蛋白设计一对引物的下游引物,代替通用引物oligDT。
4.根据权利要求1所述的快速检测土壤中病残体携带TMV方法,其特征在于:步骤(3)中所述的建立并优化LAMP体系,4μLFIP/BIP(10μM),0.5μLF3/B3(10μM),1.0μLMgSO4(100μM),1.0μLdNTPmix(10μM),2.5μL10×PCRbuffer(Mg2+-free),1.0μLBSTDNAploymerase(8U),5.0μL反转录产物作为cDNA模板,其余用ddH2O补充至25μL;反应程序为:62℃恒温水浴锅,恒温扩增反应1h,80℃反应10min,用来检测烟田土壤病残体中TMV。
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