[发明专利]一种快速检测土壤中病残体携带TMV方法在审

专利信息
申请号: 201510737364.2 申请日: 2015-11-03
公开(公告)号: CN105296626A 公开(公告)日: 2016-02-03
发明(设计)人: 刘世超;孙现超;许博文;彭浩然;朱虹;青玲 申请(专利权)人: 西南大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 代理人: 汤东凤
地址: 400715*** 国省代码: 重庆;85
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摘要:
搜索关键词: 一种 快速 检测 土壤 病残 携带 tmv 方法
【权利要求书】:

1.一种快速检测土壤中病残体携带TMV方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)提取土壤中病残体TMV总RNA;

(2)以提取的总RNA为模板,逆转录得到cDNA;

(3)以cDNA为模板,用以下两对引物进行LAMP扩增,得到扩增产物;第1对引物:

TMV-FIP5'-GCTGTGACTAACGGATCTAATACCG-AGGTTCCCTGACAGTGAC-3'

TMV-BIP5'-GAAGTTGAAAATCAGGCGAACCC-TGCGTCGTCTACTCTACG-3'第2对引物:

TMV-F3:5'-GGAAACCTTCACCACAAGT-3'

TMV-B3:5'-TATAGCGCTCCTTATGGC-3'

(4)用TAE电泳缓冲液配制2%琼脂糖凝胶,取5μLLAMP扩增产物在水平电泳槽中进行电泳,110V/100mA电泳35min,得到目标TMV的瀑布离散型条带。

2.根据权利要求1所述的快速检测土壤中病残体携带TMV方法,其特征在于:步骤A中所述的试剂盒使用,称取0.2g土壤样品代替说明书中的0.5g土壤样品。

3.根据权利要求1所述的快速检测土壤中病残体携带TMV方法,其特征在于:步骤(2)中所述的逆转录过程,根据TMV外壳蛋白设计一对引物的下游引物,代替通用引物oligDT。

4.根据权利要求1所述的快速检测土壤中病残体携带TMV方法,其特征在于:步骤(3)中所述的建立并优化LAMP体系,4μLFIP/BIP(10μM),0.5μLF3/B3(10μM),1.0μLMgSO4(100μM),1.0μLdNTPmix(10μM),2.5μL10×PCRbuffer(Mg2+-free),1.0μLBSTDNAploymerase(8U),5.0μL反转录产物作为cDNA模板,其余用ddH2O补充至25μL;反应程序为:62℃恒温水浴锅,恒温扩增反应1h,80℃反应10min,用来检测烟田土壤病残体中TMV。

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