[发明专利]可避免假阴性的手足口病毒CoxA16恒温荧光检测引物组、试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201510741942.X | 申请日: | 2015-11-02 |
公开(公告)号: | CN105219885A | 公开(公告)日: | 2016-01-06 |
发明(设计)人: | 曹东林;胡亮杉;林茂锐;石磊;周旋;钟丽梅;方晓琳;陈洵;唐大运;张璜;邓梓欣;雷达;张知洪;田军章 | 申请(专利权)人: | 广东省第二人民医院;广州迪澳生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广州市深研专利事务所 44229 | 代理人: | 姜若天 |
地址: | 510317 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 避免 阴性 手足 病毒 coxa16 恒温 荧光 检测 引物 试剂盒 方法 | ||
1.用于检测手足口病毒CoxA16的恒温荧光检测引物组合物,其包含一组检测引物和一组内标引物,其中,所述检测引物组包括一对外引物、一对内引物和一对环引物,其核苷酸序列分别如下所示:
CAA-F3:5’-AATGCTAGTGACAAGAATCTCA-3’;
CAA-B3:5’-GTTTGGCTACGACAAATGTG-3’;
CAA-FIP:5’-AAACCGGCACGGCTAAAGAAGTGTTGAACCATCACTCCA-3’;
CAA-BIP:5’-AGCATCATTACAATGCCCACCAATATCCCATCAAGTCAATGTCC-3’;
CAA-LF:5’-ATTCCCAATGGCTGTCTCC-3’;
CAA-LB:5’-GGTACACAGAACACAGATGGT-3’;
所述内标引物组包括一对外引物、一对内引物和一对环引物,其核苷酸序列分别如下所示:
CAB-F3:5’-GTTGAGTACATTGTCAGGTCA-3’;
CAB-B3:5’-CTAGCAGCCGTTGGTATC-3’;
CAB-FIP:5’-GGGTCATGGTCGGGTATTCGGCACGAGACGACATTCTT-3’;
CAB-BIP:5’-TTGAGTGTTGCTCCCGACGTCACTTGTGCGTTACGAC-3’;
CAB-LoopF:5’-TTATCGACCGCAGTGACTG-3’;
CAB-LoopB:5’-GGACAGGTAGTCACCGTTG-3’。
2.一种手足口病毒CoxA16的恒温荧光检测试剂盒,其特征在于,检测试剂盒包括权利要求1所述的检测引物组和内标引物组。
3.根据权利要求2所述的手足口病毒CoxA16的恒温荧光检测试剂盒,其特征在于,所述检测引物组及内标引物组中,外引物、内引物、环引物的摩尔比为:1-2:4-8:2-4。
4.根据权利要求2所述的手足口病毒CoxA16的恒温荧光检测试剂盒,其特征在于,包括以下成分:(1)DNA聚合酶;(2)反应液;(3)反转录酶;(4)内标靶标片段;(5)阳性对照和阴性对照。
5.根据权利要求4所述的手足口病毒CoxA16的恒温荧光检测试剂盒,其特征在于,所述DNA聚合酶为BstDNA聚合酶,所述反转录酶为AMV反转录酶。
6.根据权利要求4所述的手足口病毒CoxA16的恒温荧光检测试剂盒,其特征在于,所述恒温荧光反应液含有:6mMdNTP、10×ThermoPol反应缓冲液、120mMMgSO4水溶液、三者的体积比是7:4:3。
7.根据权利要求4所述的手足口病毒CoxA16的反转录恒温荧光检测试剂盒,其特征在于,阳性对照为含有手足口病毒CoxA16CAA基因片段的T载体克隆,阴性对照为超纯水,内标靶标片段为含有手足口病毒CoxA16CAB基因片段的T载体克隆。
8.一种手足口病毒CoxA16的恒温荧光检测方法,包括如下步骤:
(1)待检样品RNA的提取:采用病毒RNA提取试剂盒提取样品RNA;
(2)利用权利要求1的恒温荧光引物组合物对待检样品RNA进行反转录恒温扩增;
(3)结果判断:将反应管中置于恒温荧光检测仪或荧光PCR仪中,实时读取荧光信号,根据CAA基因检测结果和内标基因CAB检测结果进行判断:
CAA基因检测结果为阳性内标基因CAB检测结果全为阳性时,检测结果为阳性;
CAA基因检测结果为阴性内标基因CAB检测结果全为阳性时,检测结果为阴性;
CAA基因检测结果为阳性内标基因CAB检测结果全为阴性时,检测结果为阳性;
CAA基因检测结果为阴性内标基因CAB检测结果全为阴性时,检测结果可能为假阴性,建议重新提取RNA进行检测。
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